Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 4930535O05Rik-201ENSMUST00000184406 419 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 1600019K03Rik-201ENSMUST00000187829 477 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 1700122H20Rik-201ENSMUST00000188950 421 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 4633401B06Rik-201ENSMUST00000198169 1073 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm42472-201ENSMUST00000201626 859 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm45145-203ENSMUST00000208872 958 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm4972-201ENSMUST00000211108 1254 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 4930555F03Rik-205ENSMUST00000212179 1257 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 AC163296.1-202ENSMUST00000218395 661 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 AC166361.1-201ENSMUST00000218567 403 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 AC163296.1-201ENSMUST00000220004 1266 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm33684-201ENSMUST00000221119 263 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 AC118249.1-201ENSMUST00000224822 608 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 AC133189.3-201ENSMUST00000226269 878 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Vmn1r41-204ENSMUST00000227039 985 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm9837-201ENSMUST00000057722 731 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Chn1-201ENSMUST00000070579 1023 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Prh1-201ENSMUST00000074042 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Rps6-ps1-201ENSMUST00000074205 750 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Vpreb2-201ENSMUST00000075371 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Cep57l1-210ENSMUST00000190022 1949 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Btn2a2-201ENSMUST00000041541 2226 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Rd3l-202ENSMUST00000185354 1541 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm40893-201ENSMUST00000220507 1508 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Tmod2-206ENSMUST00000215036 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 AL606496.1-201ENSMUST00000220673 4472 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 AF366264-201ENSMUST00000071308 3157 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Cd44-206ENSMUST00000111192 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Parp8-201ENSMUST00000022239 3098 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Olfr1357-204ENSMUST00000213877 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Pard3bos1-202ENSMUST00000138535 1878 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Ighv1-82-201ENSMUST00000103549 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm25167-201ENSMUST00000104188 120 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Fgf2-203ENSMUST00000108120 526 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Amelx-203ENSMUST00000112119 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Mrps18c-202ENSMUST00000112898 460 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm12593-201ENSMUST00000120981 743 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm12828-201ENSMUST00000136115 289 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 BC016548-201ENSMUST00000144657 640 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm13017-201ENSMUST00000156409 400 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Mir1968-201ENSMUST00000157429 68 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Mir1962-201ENSMUST00000157516 121 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Zwint-204ENSMUST00000160337 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm16184-201ENSMUST00000162324 573 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm8893-201ENSMUST00000172146 1242 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm26269-201ENSMUST00000180144 126 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 4930426I24Rik-201ENSMUST00000180709 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Anks1b-209ENSMUST00000182083 416 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm4891-201ENSMUST00000182279 912 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm8304-201ENSMUST00000185744 584 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm37825-201ENSMUST00000193141 904 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm42932-201ENSMUST00000197280 744 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm43023-201ENSMUST00000197583 2106 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm43815-201ENSMUST00000197676 990 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm19254-201ENSMUST00000204828 294 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm35501-201ENSMUST00000213492 783 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 AC155934.1-201ENSMUST00000213802 322 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 AC158799.1-201ENSMUST00000214686 617 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 AC151904.2-201ENSMUST00000218683 1177 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Atp8b3-202ENSMUST00000219648 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms