Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Zbtb37-206ENSMUST00000172044 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Erbin-202ENSMUST00000053927 6103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm4319-201ENSMUST00000191139 2048 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Trp63-205ENSMUST00000115306 4691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm26545-201ENSMUST00000181082 1746 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Idh1-203ENSMUST00000169032 2283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Lrrcc1-206ENSMUST00000169079 5638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Olfr1555-ps1-201ENSMUST00000207679 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Rprd2-201ENSMUST00000090791 7756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Golph3l-202ENSMUST00000098861 2221 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm22438-201ENSMUST00000104049 132 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm23484-201ENSMUST00000104178 131 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm11954-201ENSMUST00000121403 349 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Cbx5-203ENSMUST00000122182 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm15788-201ENSMUST00000130123 613 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm13663-202ENSMUST00000145563 643 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Igkv2-95-2-201ENSMUST00000166362 222 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Olfr819-201ENSMUST00000167974 963 ntAPPRIS P2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Olfr247-201ENSMUST00000170920 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Mir1231-201ENSMUST00000175639 81 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Vmn1r-ps18-201ENSMUST00000176901 876 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm37225-201ENSMUST00000193423 325 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 1700021F02Rik-201ENSMUST00000197576 350 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm19175-201ENSMUST00000199895 916 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm36843-201ENSMUST00000209303 627 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm18562-201ENSMUST00000209949 915 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm5791-201ENSMUST00000220840 489 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Zfp874a-208ENSMUST00000225479 1092 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 AC139569.1-201ENSMUST00000226080 614 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Morn5-201ENSMUST00000028256 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Olfr448-201ENSMUST00000058668 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Cldn10-202ENSMUST00000071546 1031 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm10310-201ENSMUST00000095239 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm37254-201ENSMUST00000193542 3901 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Ceacam1-208ENSMUST00000206676 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Coro2a-201ENSMUST00000030021 4112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Unc80-201ENSMUST00000061620 13613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 AC124581.3-201ENSMUST00000224270 1624 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Ide-201ENSMUST00000131070 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Pfkfb1-201ENSMUST00000080884 1739 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Snhg17-209ENSMUST00000186993 3144 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RxraP28700 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
RxraP28700 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
RxraP28700 Cdc42bpa-204ENSMUST00000111117 9161 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
RxraP28700 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RxraP28700 Tmem232-202ENSMUST00000086722 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
RxraP28700 AF366264-201ENSMUST00000071308 3157 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RxraP28700 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
RxraP28700 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
RxraP28700 5830416I19Rik-201ENSMUST00000198687 2627 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RxraP28700 Igkv8-30-201ENSMUST00000103378 368 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm25276-201ENSMUST00000104300 124 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm22152-201ENSMUST00000116966 125 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm12931-201ENSMUST00000117046 324 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm11833-201ENSMUST00000118393 853 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm12219-201ENSMUST00000119198 443 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RxraP28700 Ccdc142os-201ENSMUST00000125657 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm15734-201ENSMUST00000163076 1040 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
RxraP28700 Mir3072-201ENSMUST00000175610 83 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm20655-201ENSMUST00000176132 473 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RxraP28700 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm37678-201ENSMUST00000192908 1146 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm37425-201ENSMUST00000193184 432 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RxraP28700 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RxraP28700 1810049I09Rik-201ENSMUST00000205499 453 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm45782-201ENSMUST00000212670 366 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RxraP28700 AC158535.1-201ENSMUST00000221487 769 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RxraP28700 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
RxraP28700 Olfr539-201ENSMUST00000078967 960 ntAPPRIS P2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RxraP28700 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RxraP28700 9130409I23Rik-201ENSMUST00000036819 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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