Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Slc22a8-201ENSMUST00000010251 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Ctage5-208ENSMUST00000175877 2612 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Fcrl5-204ENSMUST00000193229 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Tsr1-201ENSMUST00000045807 3389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Tcf4-202ENSMUST00000078486 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Anxa1-201ENSMUST00000025561 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Btnl10-202ENSMUST00000069941 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Mak-206ENSMUST00000225084 3573 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm44769-201ENSMUST00000206120 2809 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm10822-201ENSMUST00000181596 2320 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm44093-201ENSMUST00000204381 1802 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Myrfl-201ENSMUST00000048229 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm44553-201ENSMUST00000206316 2037 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Nek7-203ENSMUST00000187407 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Psg18-201ENSMUST00000003597 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm13130-201ENSMUST00000119195 1166 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm25505-201ENSMUST00000157220 246 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm25770-201ENSMUST00000158566 115 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Mir8094-201ENSMUST00000183361 117 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm37260-201ENSMUST00000193748 1251 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm22149-202ENSMUST00000196259 137 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Klk1b2-ps-201ENSMUST00000206099 786 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm45198-201ENSMUST00000206796 591 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm20274-201ENSMUST00000206967 584 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Olfr1494-201ENSMUST00000051768 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Adcy10-203ENSMUST00000111440 5078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm16506-201ENSMUST00000165553 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm6999-201ENSMUST00000180427 2658 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Prom1-201ENSMUST00000030973 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Tph2-201ENSMUST00000006949 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Ogfod1-203ENSMUST00000109556 5310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm17170-201ENSMUST00000112785 316 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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Ifnb1P01575 Hnf1aos1-203ENSMUST00000131845 740 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm24057-201ENSMUST00000158616 302 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Slc29a1-208ENSMUST00000164769 1226 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm17233-201ENSMUST00000168470 698 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Obox4-ps36-201ENSMUST00000177206 723 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Obox4-ps16-201ENSMUST00000177624 1137 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Obox4-ps17-201ENSMUST00000178341 1137 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Obox4-ps18-201ENSMUST00000179441 1137 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Mir6357-201ENSMUST00000184246 104 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 2010103J01Rik-201ENSMUST00000192375 388 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm30613-201ENSMUST00000197277 512 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm43812-202ENSMUST00000202701 581 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm44418-201ENSMUST00000204219 705 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 1700040L08Rik-201ENSMUST00000205011 541 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm5586-201ENSMUST00000206264 795 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm6213-201ENSMUST00000209966 638 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 4930466K18Rik-201ENSMUST00000219458 906 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm36719-201ENSMUST00000219518 927 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 AC154747.4-201ENSMUST00000224802 903 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 AC117949.1-201ENSMUST00000225547 419 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Rida-201ENSMUST00000022946 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Lix1-201ENSMUST00000115576 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 AC151984.1-201ENSMUST00000218261 2976 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Unc80-201ENSMUST00000061620 13613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Abcb11-202ENSMUST00000102710 4893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Nr1h5-203ENSMUST00000196983 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Hdac9-205ENSMUST00000209902 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 3830408C21Rik-202ENSMUST00000223895 1689 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms