Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Gm12253-201ENSMUST00000108825 1356 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Gm20795J3QP49 C230079O03Rik-201ENSMUST00000209560 1385 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Gm20795J3QP49 Gm5512-202ENSMUST00000220222 1522 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Gm20795J3QP49 Gm30382-202ENSMUST00000199007 1801 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Gm20795J3QP49 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Gm20795J3QP49 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Gm20795J3QP49 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Gm20795J3QP49 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Gm20795J3QP49 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Gm20795J3QP49 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Gm20795J3QP49 Gm16523-202ENSMUST00000203640 4750 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Golga1-202ENSMUST00000112850 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Nr1h5-203ENSMUST00000196983 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 4930593A02Rik-201ENSMUST00000181694 1437 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Gm24335-201ENSMUST00000104211 132 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Wfdc2-202ENSMUST00000109344 429 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Cdk2ap1-203ENSMUST00000111473 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Gm11969-201ENSMUST00000118848 356 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 n-R5s47-201ENSMUST00000122516 119 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Gm13799-201ENSMUST00000138883 838 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Gm16116-201ENSMUST00000159472 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Gm16556-201ENSMUST00000162608 471 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Gm3326-201ENSMUST00000164656 1043 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Mir3100-201ENSMUST00000174918 65 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Ighv2-9-1-201ENSMUST00000180013 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Gm5272-201ENSMUST00000182730 982 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 4931428L18Rik-203ENSMUST00000187659 423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Gm29126-201ENSMUST00000188686 151 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
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Gm20795J3QP49 4930553I04Rik-201ENSMUST00000196722 670 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Gm17835-201ENSMUST00000196870 499 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Gm42794-201ENSMUST00000197636 835 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
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Gm20795J3QP49 AC129537.1-202ENSMUST00000226619 430 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 4930563M21Rik-201ENSMUST00000060468 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 6330409D20Rik-201ENSMUST00000009695 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Atp5l-ps1-201ENSMUST00000097132 312 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Hipk3-203ENSMUST00000111125 3651 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 AI506816-205ENSMUST00000199941 2804 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Olfr1250-202ENSMUST00000111527 4386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
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Gm20795J3QP49 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Cyp2j8-201ENSMUST00000124729 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Slc24a2-202ENSMUST00000107155 2171 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Vmn2r62-201ENSMUST00000169130 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Gm7086-201ENSMUST00000219083 1482 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Hibch-201ENSMUST00000044478 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Gm24048-201ENSMUST00000102411 106 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Gm22022-201ENSMUST00000104355 127 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Gm13840-201ENSMUST00000149608 256 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Slc15a2-212ENSMUST00000168279 958 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Gm20795J3QP49 Gm4252-201ENSMUST00000174823 313 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms