Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Cast-207ENSMUST00000222588 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Uhrf1-201ENSMUST00000001258 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Itgb6-203ENSMUST00000112517 3537 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Olfr521-202ENSMUST00000219663 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Olfr521-203ENSMUST00000220001 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Olfr632-203ENSMUST00000214711 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Lcorl-201ENSMUST00000016026 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 C1s1-204ENSMUST00000162443 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Zfp780b-203ENSMUST00000205874 1907 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Pum1-204ENSMUST00000105991 4614 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Gm37633-201ENSMUST00000192858 2700 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Gm36011-201ENSMUST00000208671 2719 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Nyap2-202ENSMUST00000113494 4540 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Gm973-201ENSMUST00000114243 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Kcnj15-207ENSMUST00000113861 3385 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Rlim-202ENSMUST00000121153 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Gm43686-201ENSMUST00000197351 2439 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Uba7-201ENSMUST00000035216 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Tmem175-202ENSMUST00000078323 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Tbx5-201ENSMUST00000018407 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Gm44116-201ENSMUST00000204269 1525 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Cd44-204ENSMUST00000111190 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Olfr1392-203ENSMUST00000214170 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Mars2-201ENSMUST00000061334 11294 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Gm38302-201ENSMUST00000191676 2076 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Gm7842-201ENSMUST00000217691 1379 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Trpm8-201ENSMUST00000040210 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Gm28892-201ENSMUST00000188123 2721 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Gm28819-202ENSMUST00000187416 1335 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Zfp942-202ENSMUST00000091879 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Rdh16-201ENSMUST00000071646 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 4930562C15Rik-201ENSMUST00000100211 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Trav13n-4-201ENSMUST00000103634 267 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 9630041A04Rik-201ENSMUST00000112841 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Fate1-202ENSMUST00000114569 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 5033423K11Rik-201ENSMUST00000117311 787 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Cnep1r1-202ENSMUST00000117775 728 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Gm12383-201ENSMUST00000120628 760 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
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Gm21976J3QNN2 Gm11423-202ENSMUST00000152784 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
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Gm21976J3QNN2 Hmgn3-205ENSMUST00000187193 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 1700054A03Rik-201ENSMUST00000187368 780 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Gm6472-202ENSMUST00000187973 582 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
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Gm21976J3QNN2 Gm18559-201ENSMUST00000208249 604 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Ccl7-201ENSMUST00000021011 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
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Gm21976J3QNN2 Odf3l1-202ENSMUST00000215694 1212 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
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Gm21976J3QNN2 Gtpbp8-201ENSMUST00000023348 836 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Clec2d-201ENSMUST00000032260 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Fate1-201ENSMUST00000066116 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Vmn1r78-201ENSMUST00000078039 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Olfr417-201ENSMUST00000085862 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Olfr1259-201ENSMUST00000090695 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Gm38099-201ENSMUST00000193280 3170 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Sept11-203ENSMUST00000201421 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Gm3203-201ENSMUST00000197670 2389 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Cltc-202ENSMUST00000103186 6519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Tubgcp6-202ENSMUST00000109353 7635 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Gm38661-201ENSMUST00000216555 5814 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Rorb-203ENSMUST00000112832 9293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Eps15-204ENSMUST00000132165 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Stambpl1-202ENSMUST00000119603 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 4931403G20Rik-201ENSMUST00000180861 1699 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Gm43800-201ENSMUST00000201868 2731 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Ttll4-202ENSMUST00000113678 3762 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Sipa1l1-201ENSMUST00000053969 7488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Gm17101-201ENSMUST00000169520 1588 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Rgs8-203ENSMUST00000111812 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Gm42969-201ENSMUST00000199858 3631 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Smarcal1-201ENSMUST00000047615 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Ptgfr-202ENSMUST00000106126 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Slx4ip-202ENSMUST00000099311 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Gm46123-201ENSMUST00000217447 6424 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Mllt3-202ENSMUST00000126353 1956 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm21976J3QNN2 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms