Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 St6galnac3-204ENSMUST00000200397 8169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Gm24709-201ENSMUST00000104123 132 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Gm13708-201ENSMUST00000145170 390 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Gm26744-201ENSMUST00000181834 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 1810041H14Rik-202ENSMUST00000187218 434 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Gm20052-204ENSMUST00000202443 648 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 4833404L02Rik-201ENSMUST00000206290 908 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 AL671874.1-201ENSMUST00000223746 1123 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 4931406P16Rik-201ENSMUST00000085592 5798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Rpl29-202ENSMUST00000098994 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Smc1b-201ENSMUST00000023068 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Utp14b-ps1-201ENSMUST00000197716 2265 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Gm14896-201ENSMUST00000121311 1351 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Pdzd2-201ENSMUST00000075317 10756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 2610028E06Rik-205ENSMUST00000156350 3623 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Gm12789-201ENSMUST00000106914 883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Apoa2-203ENSMUST00000111320 470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Apoa2-204ENSMUST00000111321 518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Gm2229-201ENSMUST00000193328 710 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Gm34424-201ENSMUST00000213400 782 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Gm31343-201ENSMUST00000207967 2454 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Klb-201ENSMUST00000031096 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Tmem173-201ENSMUST00000115728 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Helz2-202ENSMUST00000108831 10109 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Zfp142-202ENSMUST00000066986 5756 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Gm20731-201ENSMUST00000193462 2288 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Dock9-206ENSMUST00000212181 7368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Fktn-201ENSMUST00000061771 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Ncald-204ENSMUST00000120746 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 4930503L19Rik-204ENSMUST00000212155 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Mrps17-203ENSMUST00000119576 5061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Brd8-202ENSMUST00000097626 3005 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Gm12369-201ENSMUST00000121343 942 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Fxyd4-207ENSMUST00000204214 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Gm24032-201ENSMUST00000083932 159 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Pum1-203ENSMUST00000097864 4017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Psg26-201ENSMUST00000094798 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Fam19a1-201ENSMUST00000075080 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Zhx3-202ENSMUST00000103112 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Chm-201ENSMUST00000026607 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Pafah2-202ENSMUST00000105870 3180 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Alms1-201ENSMUST00000072018 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Ncam1-204ENSMUST00000193547 6050 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Olfr303-203ENSMUST00000215532 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ccdc180J3QNE4 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ccdc180J3QNE4 Cyfip2-202ENSMUST00000093166 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 9530053A07Rik-204ENSMUST00000150948 7895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Prg4-203ENSMUST00000111902 3636 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Slfn4-202ENSMUST00000167596 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Gm26849-201ENSMUST00000180561 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ccdc180J3QNE4 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Gm27804-201ENSMUST00000185135 119 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Scgb1b17-201ENSMUST00000187081 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Scgb1b10-201ENSMUST00000187257 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Scgb1b15-201ENSMUST00000189118 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Gm44411-201ENSMUST00000204172 349 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Gm9110-201ENSMUST00000219035 617 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Lrrc51-202ENSMUST00000098236 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 AC158605.4-201ENSMUST00000219013 3361 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Olfr449-204ENSMUST00000214687 1921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Galnt7-202ENSMUST00000110316 3413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Myo5c-201ENSMUST00000036555 6727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Adgrl3-216ENSMUST00000121641 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Gm10687-201ENSMUST00000180670 3233 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 AC159193.3-201ENSMUST00000221902 2622 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Tssk1-201ENSMUST00000046937 3700 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Gm14772-201ENSMUST00000116562 514 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.6 ms