Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm6807-201ENSMUST00000077435 888 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1113-201ENSMUST00000079966 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Mir135b-201ENSMUST00000083501 97 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Fgf1-201ENSMUST00000040647 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm5524-201ENSMUST00000185409 2002 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm37310-201ENSMUST00000195237 2968 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 9230106D20Rik-201ENSMUST00000052806 1406 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1392-207ENSMUST00000217275 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm43343-201ENSMUST00000202454 1926 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 AC154522.1-201ENSMUST00000224647 1903 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Rps15a-204ENSMUST00000131374 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm7265-201ENSMUST00000192735 3502 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm11945-201ENSMUST00000120551 476 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm11258-201ENSMUST00000121086 1218 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm5270-201ENSMUST00000121506 1002 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm19840-201ENSMUST00000169624 882 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Apol11a-201ENSMUST00000172191 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm4252-201ENSMUST00000174823 313 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm15251-201ENSMUST00000177947 883 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Mir6415-201ENSMUST00000184064 100 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 4930599A14Rik-201ENSMUST00000186724 387 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 1700016G22Rik-202ENSMUST00000186843 594 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Oaz3-201ENSMUST00000191506 732 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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Cldn34c3J3QJW5 Gm18985-201ENSMUST00000196472 1079 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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Cldn34c3J3QJW5 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm44448-201ENSMUST00000205104 393 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm7151-201ENSMUST00000211511 954 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 4930555F03Rik-205ENSMUST00000212179 1257 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm34263-201ENSMUST00000214010 352 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 AC166052.1-201ENSMUST00000217028 397 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 AC211878.5-201ENSMUST00000221697 409 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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Cldn34c3J3QJW5 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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Cldn34c3J3QJW5 Pdcl2-201ENSMUST00000031145 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 1700024P04Rik-201ENSMUST00000054425 481 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Olfr539-201ENSMUST00000078967 960 ntAPPRIS P2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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Cldn34c3J3QJW5 Psd3-203ENSMUST00000093468 1739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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Cldn34c3J3QJW5 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 1110008L16Rik-201ENSMUST00000021411 3122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gin1-201ENSMUST00000027571 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Rad21l-202ENSMUST00000180195 1659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm20716-201ENSMUST00000138667 5288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 U2surp-201ENSMUST00000078374 3520 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm26856-201ENSMUST00000181919 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 AC153512.1-201ENSMUST00000218961 1603 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Zeb2-213ENSMUST00000176732 1762 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r79-202ENSMUST00000226953 5636 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 4933424M12Rik-201ENSMUST00000132609 1944 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm16072-201ENSMUST00000119574 2377 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Ankub1-201ENSMUST00000099091 2696 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1019-201ENSMUST00000102634 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Borcs8-202ENSMUST00000110139 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm11207-201ENSMUST00000117824 414 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm11928-201ENSMUST00000119323 437 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms