Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Chordc1-201ENSMUST00000001825 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Rgr-201ENSMUST00000022338 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Zfp800-201ENSMUST00000035930 3881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm43519-201ENSMUST00000197239 1872 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Cxcr6-201ENSMUST00000049810 1897 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Dock5-201ENSMUST00000039135 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm14891-201ENSMUST00000117378 596 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Ighv2-9-1-201ENSMUST00000180013 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm27286-201ENSMUST00000184934 179 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Mir6906-201ENSMUST00000198998 58 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 AC113031.1-201ENSMUST00000227400 432 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gbp8-201ENSMUST00000031235 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Pogz-204ENSMUST00000107269 5966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Ppp2r3c-201ENSMUST00000021410 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Ctnnd1-218ENSMUST00000111692 6170 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Aloxe3-201ENSMUST00000021268 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Fam210a-201ENSMUST00000042852 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 D030047H15Rik-201ENSMUST00000148318 2536 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Nedd4-209ENSMUST00000184450 3329 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Trdmt1-202ENSMUST00000124488 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Nat2-202ENSMUST00000163856 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Mapk8-205ENSMUST00000111945 5756 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm37090-201ENSMUST00000195694 4105 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Aagab-201ENSMUST00000041551 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm10118-201ENSMUST00000079279 2569 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Nup155-201ENSMUST00000163765 6402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm12317-201ENSMUST00000122307 319 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Olfr92-201ENSMUST00000168659 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm26505-201ENSMUST00000176208 166 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 9430069I07Rik-201ENSMUST00000179647 336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm29363-201ENSMUST00000189365 621 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm44097-201ENSMUST00000204112 563 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 AC140409.4-201ENSMUST00000215757 538 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 AC119894.1-201ENSMUST00000220399 350 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Olfr517-201ENSMUST00000084753 1055 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Dync1i2-204ENSMUST00000112138 2466 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 AC159379.2-201ENSMUST00000220244 2482 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Brd8-202ENSMUST00000097626 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 AU015836-202ENSMUST00000121565 2997 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Senp6-203ENSMUST00000165607 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm45807-201ENSMUST00000209142 2874 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Eya3-203ENSMUST00000081726 5160 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm39041-201ENSMUST00000205557 3902 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 AC164883.2-201ENSMUST00000227931 3815 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Cdk14-204ENSMUST00000115452 1567 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Zbtb43-202ENSMUST00000095035 4925 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Bank1-201ENSMUST00000041577 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 AC132596.1-201ENSMUST00000223043 2263 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Pnisr-201ENSMUST00000029911 4545 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Fto-201ENSMUST00000069718 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Ifit1-201ENSMUST00000102824 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 AC101875.1-201ENSMUST00000222666 2223 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Smco3-203ENSMUST00000203468 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 6430562O15Rik-202ENSMUST00000180808 3997 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Il5ra-201ENSMUST00000167925 1704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Rpl35a-203ENSMUST00000115076 519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm22277-201ENSMUST00000157204 277 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm25906-201ENSMUST00000158489 126 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm4907-202ENSMUST00000163718 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm27355-201ENSMUST00000185045 128 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm16571-202ENSMUST00000203839 585 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 1810049I09Rik-201ENSMUST00000205499 453 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm18586-201ENSMUST00000217265 518 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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