Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Gm42813-201ENSMUST00000200057 615 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Olfr214-202ENSMUST00000203867 1255 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm19254-201ENSMUST00000204828 294 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm33096-201ENSMUST00000210189 493 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm45338-205ENSMUST00000210795 728 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm4972-201ENSMUST00000211108 1254 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm4668-201ENSMUST00000214742 943 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm18378-201ENSMUST00000216245 628 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 AC164424.3-201ENSMUST00000220809 148 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 AC166358.8-201ENSMUST00000223288 105 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 AC124739.1-201ENSMUST00000223433 148 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Defb3-201ENSMUST00000033852 275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Cst13-201ENSMUST00000046589 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm8882-201ENSMUST00000080849 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm10805-201ENSMUST00000099710 399 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm44228-201ENSMUST00000204888 2026 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm9256-201ENSMUST00000198106 1420 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Creb5-212ENSMUST00000205120 7482 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Mfap3-201ENSMUST00000020830 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Hipk3-203ENSMUST00000111125 3651 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 CT025675.1-201ENSMUST00000228171 1567 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm43023-201ENSMUST00000197583 2106 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Trim12a-202ENSMUST00000106837 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Dpep2-202ENSMUST00000117555 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 A930004J17Rik-201ENSMUST00000192689 4610 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Cyp2j8-201ENSMUST00000124729 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Ghrh-202ENSMUST00000109536 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Pilrb1-201ENSMUST00000110978 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Lipo4-201ENSMUST00000112511 1188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm13160-201ENSMUST00000118441 627 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm15355-201ENSMUST00000118929 285 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm12593-201ENSMUST00000120981 743 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm14749-201ENSMUST00000121269 333 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm12967-201ENSMUST00000122147 289 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Zwint-204ENSMUST00000160337 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm15934-201ENSMUST00000162062 525 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm4340-201ENSMUST00000163113 807 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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Samt1A2BED8 Scgb2b20-201ENSMUST00000179248 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm27177-204ENSMUST00000184491 602 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Scgb2b18-201ENSMUST00000186529 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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Samt1A2BED8 Scgb2b11-201ENSMUST00000188293 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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Samt1A2BED8 Cnih4-205ENSMUST00000193907 531 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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Samt1A2BED8 Tial1-214ENSMUST00000205835 562 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Mrpl22-201ENSMUST00000020820 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm34474-201ENSMUST00000209645 356 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm32688-201ENSMUST00000213849 585 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 BC042761-201ENSMUST00000218344 938 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 AC167222.1-201ENSMUST00000219379 660 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 4930415O20Rik-201ENSMUST00000023728 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Hpf1-201ENSMUST00000037190 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gstm2-202ENSMUST00000066530 854 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Olfr530-201ENSMUST00000074177 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm25926-201ENSMUST00000082899 160 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Dmrtc1c2-202ENSMUST00000087899 717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm2654-201ENSMUST00000221381 1592 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm43211-201ENSMUST00000196901 1899 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Olfr1048-202ENSMUST00000215607 2981 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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