Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Gm7803-201ENSMUST00000117176 1015 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Gm15730-201ENSMUST00000121828 415 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Gm16407-201ENSMUST00000122134 567 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 4930483K19Rik-201ENSMUST00000127576 1237 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Gm15501-202ENSMUST00000140687 625 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Gm15351-203ENSMUST00000153095 406 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 4933427D06Rik-202ENSMUST00000153517 522 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Gm24130-201ENSMUST00000158536 151 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Rpl29-ps1-201ENSMUST00000161849 508 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Gm7436-201ENSMUST00000187229 391 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Gm31406-201ENSMUST00000192297 671 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Gm7804-201ENSMUST00000192784 738 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Gm37977-201ENSMUST00000193096 721 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Gm34263-201ENSMUST00000214010 352 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 AC160966.1-203ENSMUST00000214689 1186 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Gm32515-201ENSMUST00000219396 350 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Gm9289-201ENSMUST00000221269 606 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 AC140208.1-201ENSMUST00000226609 285 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Gm9801-201ENSMUST00000054860 408 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Timp1-201ENSMUST00000009530 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Ndrg3-202ENSMUST00000072298 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Lum-201ENSMUST00000038160 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Hipk3-203ENSMUST00000111125 3651 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Gm5087-201ENSMUST00000060526 1921 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Zfp239-201ENSMUST00000079405 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Gm43961-201ENSMUST00000203289 1872 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Vmn2r55-201ENSMUST00000167771 1407 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Fgf1-201ENSMUST00000040647 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Cmah-208ENSMUST00000224819 9482 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Pdlim5-205ENSMUST00000170361 2010 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Gm22438-201ENSMUST00000104049 132 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Lrrc51-206ENSMUST00000106966 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Gm12344-201ENSMUST00000117087 329 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Gm12365-201ENSMUST00000117931 568 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Gm5255-201ENSMUST00000120125 642 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Gm15586-201ENSMUST00000121218 528 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Babam2-205ENSMUST00000131995 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Gm16143-201ENSMUST00000155982 538 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Gm17660-201ENSMUST00000164471 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Ankrd55-204ENSMUST00000168684 1005 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Gm17057-201ENSMUST00000169887 591 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Gm15251-201ENSMUST00000177947 883 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Mir8114-201ENSMUST00000183582 111 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Gm18033-201ENSMUST00000186678 550 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Ighv1-17-201ENSMUST00000194435 350 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Gm42965-201ENSMUST00000201254 250 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 0610006L08Rik-202ENSMUST00000206672 803 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Gm45309-201ENSMUST00000211528 695 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 AC132237.3-201ENSMUST00000220867 549 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Gm21731-202ENSMUST00000223770 886 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 AC154747.4-202ENSMUST00000223826 852 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Olfr530-201ENSMUST00000074177 1080 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Vmn1r218-201ENSMUST00000074992 897 ntAPPRIS P2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Olfr890-201ENSMUST00000079804 945 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Gm8113-201ENSMUST00000160298 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Olfr432-203ENSMUST00000213381 4533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Cd44-205ENSMUST00000111191 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Gm44916-201ENSMUST00000208664 2194 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Gm6787-201ENSMUST00000123120 1454 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Cspp1-217ENSMUST00000186294 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Gm36814-201ENSMUST00000197457 1755 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Nrf1Q9WU00 Psg21-202ENSMUST00000182128 2066 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms