Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Cd44-205ENSMUST00000111191 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 2610020C07Rik-201ENSMUST00000181526 2925 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Trdv2-2-201ENSMUST00000103678 397 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Cdc42se1-202ENSMUST00000107199 652 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Borcs8-202ENSMUST00000110139 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Lipo4-201ENSMUST00000112511 1188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Tpi-rs8-201ENSMUST00000120382 708 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm11188-201ENSMUST00000122382 388 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm16618-201ENSMUST00000134992 955 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm11444-201ENSMUST00000146433 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm10804-202ENSMUST00000162565 867 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm8974-201ENSMUST00000175770 479 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm26436-201ENSMUST00000180325 132 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Scgb1b9-ps-201ENSMUST00000191567 266 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm43008-201ENSMUST00000202346 286 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm5586-201ENSMUST00000206264 795 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 AC132474.3-201ENSMUST00000213244 383 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 A930040O22Rik-201ENSMUST00000221662 973 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Olfr1283-201ENSMUST00000090328 1026 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Trip12-206ENSMUST00000186465 9590 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 AC131667.1-201ENSMUST00000214665 2175 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 AC123705.1-201ENSMUST00000222512 2058 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Nasp-203ENSMUST00000081182 1461 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm12299-201ENSMUST00000138819 2327 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Osbpl9-214ENSMUST00000160774 2765 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm38263-201ENSMUST00000195879 3059 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Olfr329-ps-202ENSMUST00000108823 1060 ntAPPRIS P2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Plxdc2-202ENSMUST00000114702 2146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm11207-201ENSMUST00000117824 414 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm5883-201ENSMUST00000120735 495 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Mrpl48-ps-201ENSMUST00000121413 636 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm12967-201ENSMUST00000122147 289 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm11962-201ENSMUST00000145746 255 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Ube2v1-207ENSMUST00000151365 924 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Obox2-203ENSMUST00000174076 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm19815-201ENSMUST00000175818 335 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 4930426I24Rik-201ENSMUST00000180709 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 1500004A13Rik-201ENSMUST00000183374 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Scgb2b30-201ENSMUST00000187013 336 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Scgb2b10-201ENSMUST00000191403 318 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm38337-201ENSMUST00000193986 599 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 4930557J02Rik-201ENSMUST00000202325 1075 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 4930557K07Rik-201ENSMUST00000205110 363 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm38430-201ENSMUST00000209888 1240 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Hspe1-ps1-201ENSMUST00000222955 330 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 AL590616.1-201ENSMUST00000223339 574 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 AC132590.1-201ENSMUST00000224374 1164 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Rbp7-201ENSMUST00000030848 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Cd74-201ENSMUST00000050487 1218 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Pcp4-201ENSMUST00000061739 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Olfr1427-201ENSMUST00000087825 938 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Rps15a-204ENSMUST00000131374 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Olfr472-203ENSMUST00000216937 5392 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Olfr1047-202ENSMUST00000216056 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Zfp51-201ENSMUST00000039577 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm26569-201ENSMUST00000181968 1789 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm37460-201ENSMUST00000191796 2249 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Cntrl-204ENSMUST00000113033 1817 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Coro2a-203ENSMUST00000107757 4124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Tmem175-201ENSMUST00000063272 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 233.9 ms