Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Zrsr1-201ENSMUST00000049506 3282 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Uggt1-201ENSMUST00000046875 9033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Etv5-203ENSMUST00000168774 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Olfr316-202ENSMUST00000215071 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm13270-201ENSMUST00000149137 1686 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 AC171003.1-201ENSMUST00000221667 1665 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Ighv1-26-201ENSMUST00000103510 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Odf2-206ENSMUST00000113759 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Arpp19-204ENSMUST00000167885 540 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 4930568G15Rik-202ENSMUST00000195635 996 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Defa24-201ENSMUST00000080533 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 AC159301.1-202ENSMUST00000225860 2133 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 A930030B08Rik-201ENSMUST00000207625 3965 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Mrpl35-201ENSMUST00000065103 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Pkib-202ENSMUST00000075992 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm37080-201ENSMUST00000194804 2404 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gatad2b-204ENSMUST00000199607 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm28509-201ENSMUST00000189428 2170 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm43422-201ENSMUST00000199780 3571 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Kars-ps1-201ENSMUST00000122077 1767 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Arpp21-210ENSMUST00000159451 2805 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Pex5l-211ENSMUST00000194016 4206 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Siae-204ENSMUST00000215474 4947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Synpr-202ENSMUST00000112656 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Dclk1-208ENSMUST00000198437 4315 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Unc80-206ENSMUST00000212557 9777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Bbs12-202ENSMUST00000108121 2348 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm15628-201ENSMUST00000162051 547 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Hddc3-209ENSMUST00000206480 454 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 1810014B01Rik-204ENSMUST00000218536 204 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm14851-201ENSMUST00000077452 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Olfr1265-201ENSMUST00000080311 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Olfr1129-201ENSMUST00000081034 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Atp1a4-201ENSMUST00000111243 3470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Myh15-201ENSMUST00000168680 6340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 AC125409.2-201ENSMUST00000221888 2158 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Magea10-201ENSMUST00000088481 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Prr15l-204ENSMUST00000107636 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Olfr76-203ENSMUST00000214676 3175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Sema6a-210ENSMUST00000156422 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Mir124-2hg-201ENSMUST00000185804 3844 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Rbbp6-202ENSMUST00000071590 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Heatr5b-201ENSMUST00000097281 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Arhgap1-201ENSMUST00000090614 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Rbm12-201ENSMUST00000059647 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Vmn1r181-202ENSMUST00000226843 4496 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Kdm5d-207ENSMUST00000189069 2177 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm12532-201ENSMUST00000148448 2684 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm44763-201ENSMUST00000208287 2019 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Arhgap21-213ENSMUST00000173194 6920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Epg5-201ENSMUST00000044622 9672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Ighv1-31-201ENSMUST00000103511 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Ighv1-37-201ENSMUST00000103514 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Ighv1-42-201ENSMUST00000103516 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Ighv1-43-201ENSMUST00000103517 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Ighv1-66-201ENSMUST00000103537 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm13156-201ENSMUST00000118348 321 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm15349-201ENSMUST00000121154 204 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Eif4e1b-203ENSMUST00000126785 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm28086-201ENSMUST00000191586 317 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Ighv1-29-201ENSMUST00000194116 342 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm20128-201ENSMUST00000196189 417 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm43555-201ENSMUST00000196588 310 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm9357-201ENSMUST00000207138 805 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm19047-201ENSMUST00000220922 1099 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 AC121542.2-201ENSMUST00000227529 400 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Krtap6-1-201ENSMUST00000076906 594 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Cmah-209ENSMUST00000224953 2221 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Gm6866-201ENSMUST00000188559 2549 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
OtofQ9ESF1 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
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