Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Folh1-201ENSMUST00000001824 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Adgrl2-212ENSMUST00000198779 4592 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Xrn2-201ENSMUST00000028921 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Olfr802-202ENSMUST00000203785 5535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Erc1-201ENSMUST00000032279 8356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Zfp655-205ENSMUST00000199322 4157 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Ephb2-202ENSMUST00000105845 10902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Musk-201ENSMUST00000081919 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Zfp128-202ENSMUST00000144578 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Slc8a1-202ENSMUST00000163123 2877 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Evi2a-205ENSMUST00000170799 2289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gtdc1-201ENSMUST00000049051 2197 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 2610203C20Rik-215ENSMUST00000212373 1574 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm29398-201ENSMUST00000186355 1491 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm24812-201ENSMUST00000175315 284 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm8357-201ENSMUST00000181115 1011 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Shisa5-207ENSMUST00000197483 534 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm17822-201ENSMUST00000204307 351 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm44546-201ENSMUST00000208353 368 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm34424-201ENSMUST00000213400 782 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm36758-201ENSMUST00000222594 310 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 AC133203.1-201ENSMUST00000228241 301 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm5113-201ENSMUST00000085668 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Dnah9-201ENSMUST00000080665 13798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Mybpc2-201ENSMUST00000165208 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Prrg1-202ENSMUST00000114025 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Mccc1os-201ENSMUST00000124469 3353 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Ctnnd1-224ENSMUST00000111698 5850 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Coa7-202ENSMUST00000131656 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Tmprss11e-201ENSMUST00000161306 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Usp54-202ENSMUST00000035340 6495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Wdr72-205ENSMUST00000215440 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 4930551I15Rik-201ENSMUST00000219700 2143 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Ctsc-203ENSMUST00000131108 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 R3hdm2-203ENSMUST00000105249 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm37510-201ENSMUST00000194151 4762 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Trbv13-3-201ENSMUST00000103271 340 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm11370-201ENSMUST00000120583 260 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm16276-201ENSMUST00000131218 262 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm16098-201ENSMUST00000141926 796 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm26353-201ENSMUST00000158224 255 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm29464-201ENSMUST00000187692 513 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm7867-201ENSMUST00000189856 546 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm37191-201ENSMUST00000193346 388 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm39465-202ENSMUST00000215177 470 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm30933-201ENSMUST00000217174 381 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 AC116596.2-203ENSMUST00000227345 731 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Olfr517-201ENSMUST00000084753 1055 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm8444-201ENSMUST00000092020 357 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Olfr633-201ENSMUST00000098188 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Nt5c2-201ENSMUST00000086961 3745 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms