Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm14380-201ENSMUST00000122298 431 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm43689-201ENSMUST00000195951 427 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm45044-201ENSMUST00000208078 396 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Dock1-201ENSMUST00000084488 6807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm43311-201ENSMUST00000200016 2377 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Dsg1a-201ENSMUST00000077146 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 8030451A03Rik-203ENSMUST00000141428 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Mep1a-202ENSMUST00000117137 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Zfp445-201ENSMUST00000056467 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Vmn1r208-201ENSMUST00000124841 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Spata3-203ENSMUST00000125083 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm24343-201ENSMUST00000158708 111 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm6055-201ENSMUST00000180532 378 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm8058-201ENSMUST00000217247 587 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 1700048P04Rik-201ENSMUST00000219825 369 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Defb15-201ENSMUST00000062586 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 4833420G17Rik-203ENSMUST00000224312 3406 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Aloxe3-201ENSMUST00000021268 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Map3k19-205ENSMUST00000208183 4865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm18305-201ENSMUST00000216532 2128 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Tmem43-201ENSMUST00000032183 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gcm2-201ENSMUST00000021791 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Olfr766-ps1-201ENSMUST00000204515 2909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm4853-201ENSMUST00000119359 394 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm22530-201ENSMUST00000158820 118 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Olfr92-201ENSMUST00000168659 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm20620-201ENSMUST00000177528 168 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Speer4c-202ENSMUST00000179506 480 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm28023-201ENSMUST00000184556 60 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm27825-201ENSMUST00000184586 60 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm7554-201ENSMUST00000202282 574 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm32005-201ENSMUST00000212446 959 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Ugt1a6b-201ENSMUST00000113137 2249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Cdc40-201ENSMUST00000044166 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm37962-201ENSMUST00000195535 2034 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Olfr60-202ENSMUST00000210932 2383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Pp2d1-201ENSMUST00000056198 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm3970-201ENSMUST00000198001 334 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 AC102139.1-201ENSMUST00000227000 251 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Olfr1122-201ENSMUST00000056435 1080 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Large1-201ENSMUST00000004497 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Ank3-208ENSMUST00000182029 3825 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Rnf144b-202ENSMUST00000110111 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm25346-201ENSMUST00000104509 128 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm12833-201ENSMUST00000136112 477 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm20490-201ENSMUST00000173622 198 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Mir6973b-201ENSMUST00000184185 80 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Lemd1-209ENSMUST00000191418 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm43576-201ENSMUST00000197937 871 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm44902-201ENSMUST00000206177 805 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Gm39384-201ENSMUST00000213703 743 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Hipk2-205ENSMUST00000160962 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 B020004J07Rik-202ENSMUST00000106919 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Kpna2-ps-201ENSMUST00000120025 1569 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Ccdc150-201ENSMUST00000027128 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Elf5-201ENSMUST00000028609 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms