Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Gm10637-202ENSMUST00000184702 3233 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trak1Q6PD31 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trak1Q6PD31 Gm5268-201ENSMUST00000189212 940 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Trak1Q6PD31 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trak1Q6PD31 Gm37739-201ENSMUST00000191742 1505 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trak1Q6PD31 Gm38003-201ENSMUST00000191968 1504 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trak1Q6PD31 Vmn1r-ps5-201ENSMUST00000202963 931 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Trak1Q6PD31 Gm44165-201ENSMUST00000203093 1469 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Trak1Q6PD31 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trak1Q6PD31 Gm31013-201ENSMUST00000213576 715 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trak1Q6PD31 A630072L19Rik-202ENSMUST00000221309 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trak1Q6PD31 Gm3333-202ENSMUST00000221763 1044 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Trak1Q6PD31 AC131033.1-201ENSMUST00000228223 279 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Trak1Q6PD31 Olfr1448-201ENSMUST00000054737 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trak1Q6PD31 Rnf222-201ENSMUST00000065213 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trak1Q6PD31 Tph2-201ENSMUST00000006949 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trak1Q6PD31 Olfr417-201ENSMUST00000085862 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trak1Q6PD31 Lama3-202ENSMUST00000188815 5551 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Tenm4-201ENSMUST00000107162 11021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Ncapg-201ENSMUST00000117396 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Tcam1-201ENSMUST00000044462 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Pbrm1-205ENSMUST00000112092 5009 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Olfr1360-202ENSMUST00000205788 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Prepl-202ENSMUST00000171795 3830 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Atp6v0a1-202ENSMUST00000092663 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Rgs8-203ENSMUST00000111812 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Olfr348-202ENSMUST00000213498 3540 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Dlg2-201ENSMUST00000074273 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Pfkfb1-201ENSMUST00000080884 1739 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Sc5d-201ENSMUST00000052725 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Folh1-201ENSMUST00000001824 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Ptgfr-202ENSMUST00000106126 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Gm21043-201ENSMUST00000199316 1517 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 4930517E11Rik-201ENSMUST00000129584 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Taok3-210ENSMUST00000179276 4302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Cers4-201ENSMUST00000008350 9475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Gm28884-201ENSMUST00000190367 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Gm13626-201ENSMUST00000119435 402 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Gm15527-201ENSMUST00000138259 858 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 A430048G15Rik-201ENSMUST00000149965 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Gm15624-202ENSMUST00000154953 713 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Gm22882-201ENSMUST00000157749 124 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Gm23116-201ENSMUST00000158481 67 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Slc25a5-ps-201ENSMUST00000162199 826 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Obox4-ps30-201ENSMUST00000176032 948 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Rpl31-ps25-201ENSMUST00000181557 379 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Gm17786-201ENSMUST00000182000 427 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Gm38254-201ENSMUST00000192276 1009 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Gm37700-201ENSMUST00000192617 965 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Gm17965-201ENSMUST00000193904 517 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Gm37705-201ENSMUST00000195111 577 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 5033403H07Rik-202ENSMUST00000198248 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Olfr189-ps1-201ENSMUST00000205310 804 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Gm7588-201ENSMUST00000216866 571 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Gm19217-201ENSMUST00000218238 328 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 AC105167.1-201ENSMUST00000219966 253 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Gm38560-201ENSMUST00000220169 646 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 CT030705.2-201ENSMUST00000225301 556 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Npm2-201ENSMUST00000062629 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Desi2-202ENSMUST00000069568 1193 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Stfa2l1-201ENSMUST00000079184 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Gm6887-201ENSMUST00000080945 482 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Pum1-204ENSMUST00000105991 4614 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Mpzl3-203ENSMUST00000114664 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Stat2-201ENSMUST00000085708 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Cntrl-212ENSMUST00000156933 7189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 BC053393-201ENSMUST00000050937 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Gm42972-201ENSMUST00000196937 5617 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Afap1l2-203ENSMUST00000122359 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Mstn-201ENSMUST00000027269 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Sorbs2-222ENSMUST00000141039 1699 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Gm12661-201ENSMUST00000118780 3335 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Gm43292-201ENSMUST00000199580 2449 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Slc3a1-201ENSMUST00000024944 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Ano3-201ENSMUST00000099623 6705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Ctsm-201ENSMUST00000099451 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Slc8a1-202ENSMUST00000163123 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Pramef20-201ENSMUST00000121109 1434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Gm20767-202ENSMUST00000225683 1427 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Wdfy3-205ENSMUST00000174598 10581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Slirp-204ENSMUST00000161023 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Mak-201ENSMUST00000021792 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Smarca1-203ENSMUST00000101616 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Ighv9-1-201ENSMUST00000103471 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Gm14612-201ENSMUST00000121522 881 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trak1Q6PD31 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.6 ms