Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm23786-202ENSMUST00000200181 119 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm8686-201ENSMUST00000203028 388 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm45145-203ENSMUST00000208872 958 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 5033426E14Rik-201ENSMUST00000212462 783 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Odf3l1-202ENSMUST00000215694 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm8948-201ENSMUST00000216371 370 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 4930520K02Rik-201ENSMUST00000219522 388 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 CT009718.2-202ENSMUST00000222092 704 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 AC154760.1-201ENSMUST00000227218 673 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 AC113178.1-201ENSMUST00000227616 935 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Plac8-202ENSMUST00000097437 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Ndst3-203ENSMUST00000132112 4460 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Dpep2-202ENSMUST00000117555 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Olfr308-202ENSMUST00000214977 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 B230303O12Rik-201ENSMUST00000199119 3645 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r52-208ENSMUST00000228665 3226 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Pramef20-201ENSMUST00000121109 1434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm7978-201ENSMUST00000178552 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm16429-201ENSMUST00000179824 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm7073-203ENSMUST00000190178 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 AC158981.2-201ENSMUST00000227565 1537 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Fam83b-202ENSMUST00000183437 3879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm37531-201ENSMUST00000191628 5415 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Trdv2-2-201ENSMUST00000103678 397 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm25501-201ENSMUST00000104429 132 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Borcs8-202ENSMUST00000110139 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm24195-201ENSMUST00000116804 137 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm11997-201ENSMUST00000118697 313 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm15753-201ENSMUST00000119241 1062 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm11765-201ENSMUST00000121173 1205 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s201-201ENSMUST00000122622 116 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm16336-201ENSMUST00000126011 380 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm11309-201ENSMUST00000127108 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm15416-201ENSMUST00000131080 442 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Plgrkt-208ENSMUST00000143467 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Chn2-209ENSMUST00000146114 1227 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm13872-203ENSMUST00000147082 657 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm8974-201ENSMUST00000175770 479 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm3116-201ENSMUST00000189440 1116 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Tmigd3-204ENSMUST00000198080 832 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm43103-201ENSMUST00000199021 802 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Ndufa4-203ENSMUST00000204084 409 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 AC132474.3-201ENSMUST00000213244 383 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 CT030709.2-201ENSMUST00000215521 399 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm32515-201ENSMUST00000219396 350 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Glipr1-201ENSMUST00000074805 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Olfr195-201ENSMUST00000075381 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm25259-201ENSMUST00000083048 193 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Olfr514-201ENSMUST00000084754 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1427-201ENSMUST00000087825 938 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Clec3a-201ENSMUST00000009018 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm21541-201ENSMUST00000098128 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1353-201ENSMUST00000039718 1992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 C030015A19Rik-201ENSMUST00000203368 2551 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Adgrf5-201ENSMUST00000113599 8535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Ctnna3-202ENSMUST00000105440 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Dclre1c-204ENSMUST00000115066 3828 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1115-202ENSMUST00000213513 3604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 4921504E06Rik-201ENSMUST00000062060 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Olfr312-202ENSMUST00000216407 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Zfp937-201ENSMUST00000073782 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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