Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Gm44553-201ENSMUST00000206316 2037 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm25093-201ENSMUST00000103993 132 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm11255-201ENSMUST00000120448 1180 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm16276-201ENSMUST00000131218 262 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm24057-201ENSMUST00000158616 302 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm6921-201ENSMUST00000161478 435 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 C78334-201ENSMUST00000186632 600 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm2860-201ENSMUST00000199226 707 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 A730082K24Rik-201ENSMUST00000205365 465 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm18043-201ENSMUST00000216741 739 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 1700011B04Rik-205ENSMUST00000220995 831 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 AC187103.4-201ENSMUST00000225399 300 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Vmn1r51-203ENSMUST00000226542 4164 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Rbms3-212ENSMUST00000174868 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Ikbkg-201ENSMUST00000004330 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Tubgcp5-201ENSMUST00000032627 3905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Zfp770-201ENSMUST00000050668 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Olfr212-201ENSMUST00000075756 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Abcg8-201ENSMUST00000045714 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Pdzd9-202ENSMUST00000127845 1327 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Il1f9-201ENSMUST00000057567 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Cd300lg-203ENSMUST00000107164 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Arhgap17-201ENSMUST00000098060 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Ctnnd1-213ENSMUST00000111687 6030 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Siah3-201ENSMUST00000164848 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Etl4-205ENSMUST00000114607 3055 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Farsb-201ENSMUST00000068333 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm16440-201ENSMUST00000100900 1089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm15543-201ENSMUST00000141307 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Puf60Q3UEB3 Gm7876-201ENSMUST00000169465 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm3043-201ENSMUST00000170639 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm8282-201ENSMUST00000187559 483 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm29044-202ENSMUST00000188980 300 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm24826-202ENSMUST00000197298 216 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm44227-201ENSMUST00000203576 241 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 AC122273.1-202ENSMUST00000213884 695 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 AC166078.1-201ENSMUST00000217211 584 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm3213-201ENSMUST00000219296 441 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm36607-201ENSMUST00000222750 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm34552-201ENSMUST00000223381 636 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Olfr1462-202ENSMUST00000208533 3424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Rasgef1b-210ENSMUST00000209346 3028 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Akap2-206ENSMUST00000107598 6830 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Ccr4-201ENSMUST00000054414 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Smarca1-203ENSMUST00000101616 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 AC154270.2-201ENSMUST00000226755 2306 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Rlim-202ENSMUST00000121153 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Cfap46-202ENSMUST00000129990 8180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Grhl1-201ENSMUST00000020985 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Hnrnpa3-203ENSMUST00000111962 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm36120-201ENSMUST00000214393 1734 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 2610028E06Rik-205ENSMUST00000156350 3623 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Ddx6-201ENSMUST00000170489 6065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 A130012E19Rik-201ENSMUST00000218674 3135 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Kcnb2-202ENSMUST00000175681 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Lrriq3-203ENSMUST00000194376 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Slc12a3-205ENSMUST00000212134 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Olfr1426-204ENSMUST00000219005 2507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Csde1-211ENSMUST00000198180 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Mep1a-202ENSMUST00000117137 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Klf8-202ENSMUST00000112574 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Phc3-206ENSMUST00000129817 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 A330032B11Rik-201ENSMUST00000180609 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm27156-201ENSMUST00000184589 754 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 4930568A12Rik-202ENSMUST00000188292 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Ighv6-2-201ENSMUST00000192430 295 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms