Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Hgd-203ENSMUST00000160847 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Atcay-201ENSMUST00000047408 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Rhox2-ps-201ENSMUST00000117421 322 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr383-ps1-201ENSMUST00000118895 935 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11954-201ENSMUST00000121403 349 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gtsf1-202ENSMUST00000123724 747 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 AI662270-201ENSMUST00000142709 304 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15849-201ENSMUST00000159257 335 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3261-201ENSMUST00000166886 481 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Rsph10b-204ENSMUST00000169758 702 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22348-201ENSMUST00000178674 79 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26866-201ENSMUST00000180414 802 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8079-201ENSMUST00000182695 975 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26963-201ENSMUST00000183172 941 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Il19-203ENSMUST00000187410 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28857-201ENSMUST00000188068 425 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7804-201ENSMUST00000192784 738 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43976-201ENSMUST00000203637 235 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45925-202ENSMUST00000219904 1136 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm46430-203ENSMUST00000221389 1049 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Retnlb-201ENSMUST00000023328 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Ly6c1-201ENSMUST00000065408 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23404-201ENSMUST00000082543 97 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25004-201ENSMUST00000083811 161 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr417-201ENSMUST00000085862 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Clec3a-201ENSMUST00000009018 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Gtpbp6Q3U6U5 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45153-201ENSMUST00000205957 1901 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Scn4a-201ENSMUST00000021056 6598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17916-201ENSMUST00000186137 1342 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Zbtb26-202ENSMUST00000102789 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Arel1-201ENSMUST00000043169 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10302-201ENSMUST00000174433 3535 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm35048-201ENSMUST00000192105 2802 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Cnga3-204ENSMUST00000195272 2197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 B4galt4-204ENSMUST00000114711 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 H2-Eb2-201ENSMUST00000050325 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Ccnb2-ps-202ENSMUST00000170898 2296 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Sstr2-202ENSMUST00000106630 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Pms1-201ENSMUST00000027267 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Krba1-208ENSMUST00000203371 4000 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 CT025639.2-202ENSMUST00000225298 1630 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
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Gtpbp6Q3U6U5 Zfp94-202ENSMUST00000108436 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Prkar1a-203ENSMUST00000106677 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Strip2-202ENSMUST00000115224 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Mgat4a-202ENSMUST00000143636 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37052-201ENSMUST00000194929 1831 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Olfm3-202ENSMUST00000081752 4647 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Drc3-203ENSMUST00000108722 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 6430550D23Rik-202ENSMUST00000109617 1872 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Snrpd3-201ENSMUST00000020397 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Zscan29-202ENSMUST00000110661 5072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Nctc1-202ENSMUST00000132167 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Pigq-202ENSMUST00000097368 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Gtpbp6Q3U6U5 Evc-203ENSMUST00000114154 3695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Gtpbp6Q3U6U5 Myl6-201ENSMUST00000164181 665 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Gtpbp6Q3U6U5 1700066N21Rik-201ENSMUST00000190123 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28203-201ENSMUST00000190672 695 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Ighv1-17-201ENSMUST00000194435 350 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18619-201ENSMUST00000222722 1147 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 AC124736.1-201ENSMUST00000226382 419 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr109-201ENSMUST00000031086 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm11487-201ENSMUST00000084480 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 D030068K23Rik-204ENSMUST00000212085 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 4932702P03Rik-202ENSMUST00000151220 2792 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Mannr-201ENSMUST00000193549 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Ctxn3-201ENSMUST00000091892 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Tiam1-201ENSMUST00000002588 7290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms