Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Oas1h-202ENSMUST00000171820 931 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Ighv2-9-1-201ENSMUST00000180013 369 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Mir7212-201ENSMUST00000184098 61 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm29477-201ENSMUST00000189860 499 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm29369-201ENSMUST00000190674 615 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm34333-201ENSMUST00000200363 669 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm39158-201ENSMUST00000210178 856 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm31013-201ENSMUST00000213576 715 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 CT025685.1-201ENSMUST00000213716 150 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 4930579P08Rik-201ENSMUST00000218193 1227 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm6562-201ENSMUST00000221903 464 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 AC101205.1-201ENSMUST00000227916 907 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Olfr448-201ENSMUST00000058668 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Olfr1390-201ENSMUST00000062719 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm22504-201ENSMUST00000082963 139 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gas2l3-202ENSMUST00000105298 6305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Lix1-201ENSMUST00000115576 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Scd1-201ENSMUST00000041331 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Zscan4b-202ENSMUST00000210847 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm43581-201ENSMUST00000196766 2864 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Il1f9-201ENSMUST00000057567 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Zfp882-201ENSMUST00000110002 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Dpy19l1-201ENSMUST00000115277 4747 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm28649-201ENSMUST00000189153 1581 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Hyal5-202ENSMUST00000200968 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Coro2a-201ENSMUST00000030021 4112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Npr3-204ENSMUST00000228489 1969 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 6720489N17Rik-203ENSMUST00000223338 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm13301-201ENSMUST00000121728 2446 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Tm9sf4-201ENSMUST00000089027 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 A830010M20Rik-204ENSMUST00000112671 6756 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Skil-202ENSMUST00000117728 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm37915-201ENSMUST00000195134 3261 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Rftn2-201ENSMUST00000027121 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Vps13a-201ENSMUST00000068156 10838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 AC140409.2-201ENSMUST00000216936 3079 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Olfr96-203ENSMUST00000214482 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm22231-201ENSMUST00000101027 73 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 n-R5s172-201ENSMUST00000104508 114 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 A330102I10Rik-201ENSMUST00000130109 501 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 A430048G15Rik-201ENSMUST00000149965 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm6507-201ENSMUST00000159767 652 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Obox4-ps30-201ENSMUST00000176032 948 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Dnah7c-201ENSMUST00000178395 612 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Polr2k-202ENSMUST00000180159 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Rpl31-ps25-201ENSMUST00000181557 379 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm6931-201ENSMUST00000183103 371 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Tshb-205ENSMUST00000197322 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 4930584F24Rik-204ENSMUST00000198070 1163 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm4972-201ENSMUST00000211108 1254 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm45766-201ENSMUST00000211900 478 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 AC127224.1-201ENSMUST00000218094 453 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 AC151904.5-201ENSMUST00000218975 549 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 CT030166.4-201ENSMUST00000220640 404 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm31711-201ENSMUST00000220687 196 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Aph1c-201ENSMUST00000057261 715 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Vmn1r188-201ENSMUST00000091739 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm29811-201ENSMUST00000197386 1671 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Ermap-206ENSMUST00000138395 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Trpm8-204ENSMUST00000171176 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Rdh1-201ENSMUST00000073639 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Cul5-202ENSMUST00000120122 5945 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Prkacb-201ENSMUST00000005164 4001 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Fmo9-202ENSMUST00000148677 2462 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Mmp10-201ENSMUST00000034488 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Ncald-204ENSMUST00000120746 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Olfr656-202ENSMUST00000215575 4091 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Pcyt1b-201ENSMUST00000045898 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 A830010M20Rik-203ENSMUST00000100951 4545 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm15217-201ENSMUST00000111826 733 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm6743-201ENSMUST00000117345 1066 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Olfr634-ps1-201ENSMUST00000119267 955 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm13776-201ENSMUST00000122236 1261 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm2735-201ENSMUST00000136133 277 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm12911-201ENSMUST00000140639 703 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm26357-201ENSMUST00000158218 115 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm9047-201ENSMUST00000171317 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Ltf-209ENSMUST00000198884 616 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 9230114K14Rik-204ENSMUST00000199805 695 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Olfr451-ps1-201ENSMUST00000205127 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
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