Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Rnase6-202ENSMUST00000226194 2452 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Sdr42e1-201ENSMUST00000037955 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm43323-201ENSMUST00000202328 4258 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm14580-201ENSMUST00000119122 718 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm12506-201ENSMUST00000123620 806 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm26410-201ENSMUST00000157670 261 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm7152-201ENSMUST00000163570 605 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprkP35822 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm31861-201ENSMUST00000204563 672 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm9367-201ENSMUST00000205703 546 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprkP35822 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprkP35822 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm7995-201ENSMUST00000089789 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Crebbp-205ENSMUST00000205765 7749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm39323-201ENSMUST00000215913 2942 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Cdh16-204ENSMUST00000211903 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprkP35822 R3hdm2-203ENSMUST00000105249 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Stil-201ENSMUST00000030490 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Myadm-204ENSMUST00000203566 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Zfp426-210ENSMUST00000167457 4262 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Znfx1-202ENSMUST00000067584 4147 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Glyat-201ENSMUST00000044976 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Dennd2c-204ENSMUST00000173206 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Rbm28-201ENSMUST00000007993 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm12099-201ENSMUST00000118660 750 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm2026-203ENSMUST00000174416 532 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm36965-201ENSMUST00000193797 394 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm5694-201ENSMUST00000195648 641 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Rpl19-ps9-201ENSMUST00000205423 588 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprkP35822 4930435C17Rik-202ENSMUST00000210759 974 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprkP35822 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprkP35822 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Olfr517-202ENSMUST00000216500 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprkP35822 A130012E19Rik-201ENSMUST00000218674 3135 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprkP35822 AC158605.4-201ENSMUST00000219013 3361 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Cep72-201ENSMUST00000036456 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gcm2-201ENSMUST00000021791 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gosr1-201ENSMUST00000010536 4289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Katnb1-201ENSMUST00000034239 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprkP35822 C1qtnf7-201ENSMUST00000076939 3879 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm28370-201ENSMUST00000185303 3375 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Mcc-201ENSMUST00000089874 7858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Nos1-202ENSMUST00000102557 4591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gpr156-201ENSMUST00000061274 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Drp2-206ENSMUST00000153424 7135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Phc3-206ENSMUST00000129817 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Olfr1360-202ENSMUST00000205788 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprkP35822 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprkP35822 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Olfr519-201ENSMUST00000084752 960 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Phldb2-202ENSMUST00000076333 5347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Fam19a1-201ENSMUST00000075080 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Atp7a-202ENSMUST00000113557 4900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm28955-201ENSMUST00000188167 2166 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm28509-201ENSMUST00000189428 2170 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm15759-201ENSMUST00000161126 3723 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Pkn2-210ENSMUST00000174422 2904 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprkP35822 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Wipf3-205ENSMUST00000163746 4102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Fam193a-201ENSMUST00000094867 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Csf3r-201ENSMUST00000030673 3160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Siae-204ENSMUST00000215474 4947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Ggta1-205ENSMUST00000113002 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Olfr410-202ENSMUST00000213831 5070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm44104-201ENSMUST00000204736 3777 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm26849-201ENSMUST00000180561 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Prg4-203ENSMUST00000111902 3636 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Trbv4-201ENSMUST00000103265 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
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