Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Gm45627-201ENSMUST00000210130 977 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 AC155934.1-201ENSMUST00000213802 322 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Gm18378-201ENSMUST00000216245 628 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Gm5250-201ENSMUST00000059065 321 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Gm12295-201ENSMUST00000128453 3189 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Lsmem1-202ENSMUST00000220951 2152 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Ncoa2-202ENSMUST00000068304 8006 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Trim12c-202ENSMUST00000130139 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Fv1-201ENSMUST00000094481 1380 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Rslcan18-201ENSMUST00000091526 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Scyl3-203ENSMUST00000161908 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 AC123705.1-201ENSMUST00000222512 2058 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Scgb1b7-201ENSMUST00000108097 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Clec4n-202ENSMUST00000112554 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Gm13929-201ENSMUST00000117553 1125 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Gm13160-201ENSMUST00000118441 627 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Gm11491-201ENSMUST00000129441 1118 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Gm17660-201ENSMUST00000164471 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Rpain-211ENSMUST00000169965 343 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Trav9n-3-201ENSMUST00000177705 575 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Trav9d-3-201ENSMUST00000178252 575 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Rps19-ps5-201ENSMUST00000180745 403 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Gm37676-201ENSMUST00000195496 507 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 1700094M23Rik-201ENSMUST00000197695 695 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Olfr664-202ENSMUST00000211596 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Olfr863-ps1-201ENSMUST00000213073 929 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 AC166052.1-201ENSMUST00000217028 397 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 1700066J03Rik-202ENSMUST00000224280 516 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Clec4n-201ENSMUST00000024118 1229 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Churc1-201ENSMUST00000041262 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Olfr905-201ENSMUST00000051111 937 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Olfr1535-201ENSMUST00000068163 981 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Olfr742-201ENSMUST00000089836 1120 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Olfr1179-201ENSMUST00000099825 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Olfr305-204ENSMUST00000216700 3734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Gm15950-201ENSMUST00000162902 1973 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Gykl1-201ENSMUST00000066193 1990 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PrkcdP28867 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
PrkcdP28867 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
PrkcdP28867 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PrkcdP28867 CT025639.1-201ENSMUST00000223906 1375 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PrkcdP28867 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms