Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gbp7-201ENSMUST00000045097 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm38081-201ENSMUST00000192680 1645 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 AC124581.3-201ENSMUST00000224270 1624 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm7978-202ENSMUST00000201129 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 BC061212-201ENSMUST00000094587 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Skint7-204ENSMUST00000163281 1423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Olfr1284-201ENSMUST00000062407 1774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Phc3-210ENSMUST00000177992 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Vmn1r176-202ENSMUST00000226319 2930 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Glrb-206ENSMUST00000194085 1341 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Kctd16-201ENSMUST00000091927 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Dpp10-202ENSMUST00000112606 15297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Nsd2-204ENSMUST00000114397 5738 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Olfr43-202ENSMUST00000205664 2018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Fam205a1-201ENSMUST00000107979 4146 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Slc6a18-202ENSMUST00000109679 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Far1-201ENSMUST00000033018 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Olfr1273-ps-201ENSMUST00000214356 4698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 AC123705.1-201ENSMUST00000222512 2058 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Zfp385b-211ENSMUST00000171063 2668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Psd3-206ENSMUST00000120071 9203 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm43430-201ENSMUST00000196513 3897 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 BC067074-201ENSMUST00000078163 3546 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm39327-201ENSMUST00000213594 1982 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 AC126251.1-201ENSMUST00000228170 2707 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Spata1-202ENSMUST00000093951 2712 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Nppb-201ENSMUST00000103231 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Cdc42se1-202ENSMUST00000107199 652 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm22152-201ENSMUST00000116966 125 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm15209-201ENSMUST00000117703 400 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm11348-201ENSMUST00000118813 318 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm12959-201ENSMUST00000119396 403 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm12687-201ENSMUST00000119752 706 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm12410-201ENSMUST00000124989 405 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm6689-201ENSMUST00000130905 481 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Pla2g2a-203ENSMUST00000135748 788 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm16174-201ENSMUST00000137373 402 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm22224-201ENSMUST00000157357 93 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm26182-201ENSMUST00000157688 116 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Mir1981-201ENSMUST00000157934 82 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm20617-201ENSMUST00000177082 717 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm5973-201ENSMUST00000178542 496 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm27401-201ENSMUST00000184052 173 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Mir8095-201ENSMUST00000185103 129 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm28888-201ENSMUST00000186556 316 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm28087-201ENSMUST00000189195 767 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 C430002N11Rik-204ENSMUST00000190054 443 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm28239-201ENSMUST00000190225 447 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm29137-201ENSMUST00000190301 520 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm8407-201ENSMUST00000192719 427 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm37585-201ENSMUST00000195440 280 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm30613-201ENSMUST00000197277 512 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Shisa5-207ENSMUST00000197483 534 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm43044-201ENSMUST00000198091 379 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm30270-201ENSMUST00000202675 524 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm43812-202ENSMUST00000202701 581 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm5314-201ENSMUST00000204852 466 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 A730082K24Rik-202ENSMUST00000205795 658 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 E230032D23Rik-202ENSMUST00000207959 451 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 A330076H08Rik-203ENSMUST00000208822 1164 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm45388-202ENSMUST00000211101 815 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm32842-201ENSMUST00000212653 738 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm17875-201ENSMUST00000216005 941 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Olfr510-204ENSMUST00000217170 2997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 CT009718.2-202ENSMUST00000222092 704 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Ang5-201ENSMUST00000066719 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Olfr1322-201ENSMUST00000070304 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Olfr888-201ENSMUST00000075228 945 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Cbx3-ps4-201ENSMUST00000091531 549 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Tctex1d1-202ENSMUST00000116317 1772 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Vpreb2P13373 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms