Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TtrP07309 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm9894-201ENSMUST00000171257 2904 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TtrP07309 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TtrP07309 Slc17a1-201ENSMUST00000006785 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TtrP07309 Ubr4-212ENSMUST00000165860 15798 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TtrP07309 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TtrP07309 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
TtrP07309 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
TtrP07309 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
TtrP07309 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
TtrP07309 Dthd1-201ENSMUST00000170704 2427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
TtrP07309 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
TtrP07309 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
TtrP07309 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
TtrP07309 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
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TtrP07309 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
TtrP07309 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
TtrP07309 4921504E06Rik-201ENSMUST00000062060 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
TtrP07309 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
TtrP07309 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
TtrP07309 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TtrP07309 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
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TtrP07309 Lypd8-201ENSMUST00000013787 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TtrP07309 9530026F06Rik-201ENSMUST00000141000 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
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TtrP07309 Gm11948-201ENSMUST00000142322 539 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
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TtrP07309 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
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TtrP07309 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
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TtrP07309 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TtrP07309 Olfr1491-202ENSMUST00000214007 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TtrP07309 Olfr1491-203ENSMUST00000215493 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TtrP07309 Olfr1491-205ENSMUST00000216377 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TtrP07309 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TtrP07309 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TtrP07309 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TtrP07309 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TtrP07309 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TtrP07309 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TtrP07309 Gm37245-201ENSMUST00000195137 2713 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TtrP07309 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TtrP07309 Gm13040-202ENSMUST00000169056 2104 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TtrP07309 Rd3l-202ENSMUST00000185354 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TtrP07309 Gm4070-201ENSMUST00000106766 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TtrP07309 Gvin1-201ENSMUST00000006667 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TtrP07309 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TtrP07309 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TtrP07309 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TtrP07309 Gm10401-201ENSMUST00000100848 607 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TtrP07309 Igkv4-81-201ENSMUST00000103340 290 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms