Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ccdc180J3QNE4 Gm37439-201ENSMUST00000193150 856 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Gm19035-202ENSMUST00000194575 959 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ccdc180J3QNE4 Sprr2a3-201ENSMUST00000090872 682 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ccdc180J3QNE4 Gm21671-201ENSMUST00000162387 2421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Sec22a-201ENSMUST00000043521 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Add1-205ENSMUST00000114340 3761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ccdc180J3QNE4 AC140409.2-201ENSMUST00000216936 3079 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Nod2-202ENSMUST00000109634 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Htr4-201ENSMUST00000027560 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Kcnu1-202ENSMUST00000120653 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ccdc180J3QNE4 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Gm28395-201ENSMUST00000187794 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Gm28571-201ENSMUST00000188922 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Add1-201ENSMUST00000001108 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Ptprc-207ENSMUST00000183301 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Cacna1f-202ENSMUST00000115726 6079 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Gm45904-201ENSMUST00000213082 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Thg1l-202ENSMUST00000109254 2202 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 AC122426.2-201ENSMUST00000216522 2947 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Map3k7-204ENSMUST00000108184 5491 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ccdc180J3QNE4 Gm21761-201ENSMUST00000179502 516 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ccdc180J3QNE4 4930563H07Rik-201ENSMUST00000203494 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ccdc180J3QNE4 Tgs1-201ENSMUST00000052712 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ccdc180J3QNE4 Wdr44-202ENSMUST00000101670 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 1500004A13Rik-202ENSMUST00000183707 6054 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ccdc180J3QNE4 Olfr1346-202ENSMUST00000207658 4429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Gm43534-201ENSMUST00000197685 2853 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ccdc180J3QNE4 Gm32585-201ENSMUST00000198586 764 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Gm45350-201ENSMUST00000210560 509 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Map4k4-209ENSMUST00000192509 3918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Gm9268-202ENSMUST00000173815 2565 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Sema6a-210ENSMUST00000156422 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Slirp-204ENSMUST00000161023 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Nup214-201ENSMUST00000065398 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Crb1-201ENSMUST00000059825 5901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Pramel-201ENSMUST00000118979 1383 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Eml1-201ENSMUST00000054955 3879 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Gm13619-201ENSMUST00000155722 2138 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc180J3QNE4 Pik3r4-210ENSMUST00000191268 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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