Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 1810013D15Rik-203ENSMUST00000196971 1450 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Taf4bG5E8Z2 Gm4319-201ENSMUST00000191139 2048 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Taf4bG5E8Z2 Garnl3-201ENSMUST00000049618 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Taf4bG5E8Z2 Slc4a10-202ENSMUST00000102735 5482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Taf4bG5E8Z2 Gm1587-201ENSMUST00000100372 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Taf4bG5E8Z2 Gm22438-201ENSMUST00000104049 132 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Taf4bG5E8Z2 Gm8644-201ENSMUST00000118619 596 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Taf4bG5E8Z2 Gm13038-201ENSMUST00000119886 459 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Taf4bG5E8Z2 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Taf4bG5E8Z2 Gm13840-201ENSMUST00000149608 256 ntTSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Taf4bG5E8Z2 Gm22636-201ENSMUST00000158142 275 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Taf4bG5E8Z2 Gm16580-201ENSMUST00000162696 1044 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Taf4bG5E8Z2 Slc29a1-208ENSMUST00000164769 1226 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Taf4bG5E8Z2 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Taf4bG5E8Z2 Gm29755-201ENSMUST00000196976 948 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Taf4bG5E8Z2 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Taf4bG5E8Z2 Lmo3-208ENSMUST00000203435 572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Taf4bG5E8Z2 Gm18484-201ENSMUST00000204389 991 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Taf4bG5E8Z2 Gm45241-201ENSMUST00000211237 634 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Taf4bG5E8Z2 CT030709.2-201ENSMUST00000215521 399 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Taf4bG5E8Z2 Gm7588-201ENSMUST00000216866 571 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Taf4bG5E8Z2 Gm18899-201ENSMUST00000217663 546 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Taf4bG5E8Z2 Gm36719-201ENSMUST00000219518 927 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Taf4bG5E8Z2 Gm19095-201ENSMUST00000220533 730 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Taf4bG5E8Z2 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Taf4bG5E8Z2 AC164294.1-201ENSMUST00000224682 688 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Taf4bG5E8Z2 Olfr648-201ENSMUST00000052659 951 ntAPPRIS P1 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Taf4bG5E8Z2 AC154903.1-201ENSMUST00000222121 2705 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Taf4bG5E8Z2 Kcnab1-201ENSMUST00000049230 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Taf4bG5E8Z2 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Taf4bG5E8Z2 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Taf4bG5E8Z2 Gm20767-202ENSMUST00000225683 1427 ntAPPRIS P1 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Taf4bG5E8Z2 Fryl-202ENSMUST00000101127 11340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Taf4bG5E8Z2 Gm20731-201ENSMUST00000193462 2288 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Taf4bG5E8Z2 Slco2b1-202ENSMUST00000107086 3993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Taf4bG5E8Z2 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Taf4bG5E8Z2 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC8.09□□□□□ -1.12
Taf4bG5E8Z2 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.12
Taf4bG5E8Z2 Eaf2-202ENSMUST00000075946 1878 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.12
Taf4bG5E8Z2 Cyp4a30b-201ENSMUST00000119958 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Taf4bG5E8Z2 4933406L23Rik-201ENSMUST00000203567 1509 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Taf4bG5E8Z2 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Taf4bG5E8Z2 Lrriq3-203ENSMUST00000194376 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Taf4bG5E8Z2 Pogz-203ENSMUST00000107266 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Taf4bG5E8Z2 Cd160-202ENSMUST00000107074 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Taf4bG5E8Z2 Cyfip1-202ENSMUST00000085255 4195 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Taf4bG5E8Z2 Gm23834-201ENSMUST00000104436 129 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Taf4bG5E8Z2 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Taf4bG5E8Z2 9630041A04Rik-201ENSMUST00000112841 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Taf4bG5E8Z2 Tceal7-201ENSMUST00000113116 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Taf4bG5E8Z2 Mageb8-ps-201ENSMUST00000117228 1033 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Taf4bG5E8Z2 Gm14248-201ENSMUST00000117790 544 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Taf4bG5E8Z2 Gm13175-201ENSMUST00000139479 466 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Taf4bG5E8Z2 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Taf4bG5E8Z2 Mir6403-201ENSMUST00000185007 129 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Taf4bG5E8Z2 Olfr318-201ENSMUST00000189911 1026 ntAPPRIS P1 BASIC8.08□□□□□ -1.12
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Taf4bG5E8Z2 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
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Taf4bG5E8Z2 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Taf4bG5E8Z2 Gm42558-201ENSMUST00000200982 265 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Taf4bG5E8Z2 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Taf4bG5E8Z2 Gm42573-201ENSMUST00000202327 478 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Taf4bG5E8Z2 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Taf4bG5E8Z2 Gm8633-201ENSMUST00000218457 558 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
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Taf4bG5E8Z2 1700001C19Rik-202ENSMUST00000073143 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Taf4bG5E8Z2 Defa35-201ENSMUST00000078121 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
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Taf4bG5E8Z2 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Taf4bG5E8Z2 Gucy1b2-203ENSMUST00000165651 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Taf4bG5E8Z2 Clasp1-204ENSMUST00000178710 7566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Taf4bG5E8Z2 Aadat-202ENSMUST00000209338 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Taf4bG5E8Z2 Tank-202ENSMUST00000112494 2698 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Taf4bG5E8Z2 Gja5-201ENSMUST00000072600 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Taf4bG5E8Z2 Dclk1-202ENSMUST00000070418 7012 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Taf4bG5E8Z2 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Taf4bG5E8Z2 Gm29824-201ENSMUST00000213183 3285 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Taf4bG5E8Z2 Gabpb2-205ENSMUST00000136139 8661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Taf4bG5E8Z2 Mfap1b-201ENSMUST00000056732 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Taf4bG5E8Z2 Gm18537-202ENSMUST00000206215 1503 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Taf4bG5E8Z2 Gm37080-201ENSMUST00000194804 2404 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Taf4bG5E8Z2 Vmn2r63-201ENSMUST00000163803 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Taf4bG5E8Z2 Gm42772-201ENSMUST00000199945 3041 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Taf4bG5E8Z2 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Taf4bG5E8Z2 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Taf4bG5E8Z2 Mroh4-201ENSMUST00000023271 3583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Taf4bG5E8Z2 AC123954.1-201ENSMUST00000222404 3272 ntAPPRIS P1 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Taf4bG5E8Z2 Gm44255-201ENSMUST00000203456 2053 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Taf4bG5E8Z2 Trmt10b-201ENSMUST00000044673 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Taf4bG5E8Z2 Olfr745-202ENSMUST00000213127 1930 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Taf4bG5E8Z2 Olfr907-203ENSMUST00000214264 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Taf4bG5E8Z2 Adgrl2-205ENSMUST00000196526 5615 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Taf4bG5E8Z2 Gm45406-201ENSMUST00000210161 1637 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Taf4bG5E8Z2 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
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