Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 R3hdm2-203ENSMUST00000105249 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 U2surp-209ENSMUST00000217176 3111 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Cnep1r1-203ENSMUST00000121097 2209 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Kif14-201ENSMUST00000047817 8770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Med1-203ENSMUST00000107545 8024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Rasgrf2-201ENSMUST00000099326 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Ces2g-201ENSMUST00000043183 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Supt5-201ENSMUST00000003527 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gm42536-201ENSMUST00000197562 1613 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 0610037L13Rik-204ENSMUST00000106727 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc7b-203ENSMUST00000108745 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gm11410-201ENSMUST00000120053 1143 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Pogk-201ENSMUST00000127596 769 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gm25721-201ENSMUST00000157496 171 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gm26407-201ENSMUST00000158504 307 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gm17521-201ENSMUST00000165345 468 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Trav9n-3-201ENSMUST00000177705 575 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Trav9d-3-201ENSMUST00000178252 575 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gm16596-201ENSMUST00000180576 604 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Stpg4-203ENSMUST00000187078 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gm37756-201ENSMUST00000191834 942 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gm37432-201ENSMUST00000195294 341 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gm8891-201ENSMUST00000198546 832 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gm42884-201ENSMUST00000200729 422 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gm3604-203ENSMUST00000202194 736 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gm45269-201ENSMUST00000210359 282 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gm30808-201ENSMUST00000211166 845 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 0610005C13Rik-211ENSMUST00000211530 402 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 AC132304.1-201ENSMUST00000218860 135 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gm45941-201ENSMUST00000221907 675 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gm9280-201ENSMUST00000223155 517 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 AC207128.2-202ENSMUST00000224010 808 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 AC122877.1-201ENSMUST00000228873 218 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Cysltr1-201ENSMUST00000064892 1059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Ocm-202ENSMUST00000085704 330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Olfr654-201ENSMUST00000098173 1155 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Deptor-202ENSMUST00000096433 8547 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Psg20-201ENSMUST00000076677 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 A330076C08Rik-202ENSMUST00000223513 1937 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Zfp827-202ENSMUST00000098614 7581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Chrna2-201ENSMUST00000022620 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gja1-201ENSMUST00000068581 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gm44141-201ENSMUST00000204231 1583 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Naip1-204ENSMUST00000222155 5361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Elp3-201ENSMUST00000022609 2851 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc80-202ENSMUST00000099498 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Aebp1-201ENSMUST00000102923 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Pcdhb8-201ENSMUST00000051163 3334 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Mpdz-201ENSMUST00000102830 7512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Trim12a-202ENSMUST00000106837 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Zscan21-205ENSMUST00000110961 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gria3-201ENSMUST00000076349 5192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Tprkb-201ENSMUST00000067137 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Hdac5Q9Z2V6 Ect2l-204ENSMUST00000208948 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Hdac5Q9Z2V6 CT009546.2-201ENSMUST00000223012 3476 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Myt1-201ENSMUST00000081125 5327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Hdac5Q9Z2V6 Cep162-201ENSMUST00000093802 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Hdac5Q9Z2V6 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Hdac5Q9Z2V6 1810017P11Rik-201ENSMUST00000202592 558 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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Hdac5Q9Z2V6 Gm44691-201ENSMUST00000207562 324 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Olfr848-ps1-201ENSMUST00000212241 930 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 AC117688.1-201ENSMUST00000213142 832 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Hdac5Q9Z2V6 Gm8137-201ENSMUST00000218997 463 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1291-ps1-202ENSMUST00000219064 897 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 4930453C13Rik-201ENSMUST00000222376 765 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 CT571256.1-201ENSMUST00000226045 585 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 AC152394.2-202ENSMUST00000228503 1064 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 AC117202.3-201ENSMUST00000228532 310 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 CT030238.4-201ENSMUST00000228579 801 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Olfr139-201ENSMUST00000050678 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Ang5-201ENSMUST00000066719 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 n-R5s196-201ENSMUST00000083136 117 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Lcn11-201ENSMUST00000091278 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Dlg2-202ENSMUST00000098308 2329 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1226-201ENSMUST00000099790 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Alpk1-201ENSMUST00000029662 4795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 2700046A07Rik-202ENSMUST00000067450 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 AC154461.2-201ENSMUST00000225462 1980 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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