Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Gm13304-201ENSMUST00000098123 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm6786-201ENSMUST00000203165 1915 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm15462-201ENSMUST00000133653 4580 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Slc5a9-202ENSMUST00000102720 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Mfap1b-201ENSMUST00000056732 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Tnik-203ENSMUST00000159680 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Klhl23-201ENSMUST00000053087 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Ddx18-201ENSMUST00000001724 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Slfn9-201ENSMUST00000038211 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm19801-201ENSMUST00000218231 1882 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Hsf3-201ENSMUST00000059003 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Frem1-202ENSMUST00000107230 9690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Olfr101-202ENSMUST00000214376 2989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Ogfod1-203ENSMUST00000109556 5310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Ctage5-223ENSMUST00000219140 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Myrfl-201ENSMUST00000048229 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm13301-201ENSMUST00000121728 2446 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm28509-201ENSMUST00000189428 2170 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm44021-201ENSMUST00000203055 3516 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Olfr45-202ENSMUST00000214637 6157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Larp1b-201ENSMUST00000026862 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm14471-201ENSMUST00000141035 2358 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gip-201ENSMUST00000103156 607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Trav13n-4-201ENSMUST00000103634 267 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm25396-201ENSMUST00000103981 133 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Atp5h-203ENSMUST00000106537 682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm12590-201ENSMUST00000134226 404 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Erich2os-201ENSMUST00000150702 608 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm25505-201ENSMUST00000157220 246 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm23077-201ENSMUST00000157854 116 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Atxn3-205ENSMUST00000161011 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm7244-201ENSMUST00000164658 455 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm29369-201ENSMUST00000190674 615 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm28644-201ENSMUST00000191364 585 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm21762-202ENSMUST00000225881 830 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Olfr1502-201ENSMUST00000074221 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Zbtb6-201ENSMUST00000053098 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm37077-201ENSMUST00000195723 3691 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Anks1b-201ENSMUST00000099364 1383 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm13769-202ENSMUST00000214797 2340 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm6999-201ENSMUST00000180427 2658 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm37161-201ENSMUST00000191994 2697 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Psg26-201ENSMUST00000094798 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Dclk1-208ENSMUST00000198437 4315 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm12800-201ENSMUST00000075999 1455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Odf2-204ENSMUST00000113756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm37937-201ENSMUST00000194130 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Dock5-201ENSMUST00000039135 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm45793-201ENSMUST00000207900 1342 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm40778-201ENSMUST00000217825 1344 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Nyap2-205ENSMUST00000137862 3393 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Ppfia2-203ENSMUST00000217854 8885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm37790-201ENSMUST00000193136 3346 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 3110043O21Rik-201ENSMUST00000084724 3413 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm29364-201ENSMUST00000185289 2167 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm28547-201ENSMUST00000186357 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm29446-201ENSMUST00000190887 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Ifit3-201ENSMUST00000102825 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm3591-201ENSMUST00000164408 1745 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Homer1-209ENSMUST00000109496 772 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Apoa2-202ENSMUST00000111319 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm8662-201ENSMUST00000118644 574 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Rpl36-ps7-201ENSMUST00000119462 315 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm22000-201ENSMUST00000153087 730 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm17786-201ENSMUST00000182000 427 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm6931-201ENSMUST00000183103 371 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Mir7005-201ENSMUST00000185089 69 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm28070-201ENSMUST00000191502 445 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm5723-201ENSMUST00000203096 432 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm44971-201ENSMUST00000206192 337 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms