Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm4258-201ENSMUST00000182127 506 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm28140-201ENSMUST00000190148 1271 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Il9-201ENSMUST00000022019 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 4921521D15Rik-201ENSMUST00000197578 1927 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Olfr666-202ENSMUST00000214757 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Pkd1l3-203ENSMUST00000212537 6576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Prdm10-205ENSMUST00000215847 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm8107-201ENSMUST00000117477 2009 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Cdhr1-201ENSMUST00000022337 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm14547-201ENSMUST00000138341 371 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 4930551L18Rik-201ENSMUST00000156086 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm29144-201ENSMUST00000189235 339 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm28607-201ENSMUST00000190142 339 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm28121-201ENSMUST00000191420 339 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 AC153870.1-201ENSMUST00000219599 560 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Klrc2-201ENSMUST00000071920 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm4319-201ENSMUST00000191139 2048 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Trim2-202ENSMUST00000065380 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm29571-201ENSMUST00000191547 1909 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 5430403N17Rik-201ENSMUST00000210717 2553 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Mroh2a-201ENSMUST00000061013 7526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Kdm4c-201ENSMUST00000030102 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gria4-201ENSMUST00000027020 5441 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Brpf1-201ENSMUST00000113117 4540 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Rdh1-201ENSMUST00000073639 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Ighv9-1-201ENSMUST00000103471 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Oas1h-202ENSMUST00000171820 931 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm6556-201ENSMUST00000181118 362 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm28467-201ENSMUST00000190981 318 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Vmn1r22-205ENSMUST00000228322 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Olfr777-201ENSMUST00000080313 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Tmc3-203ENSMUST00000164944 3306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Carf-206ENSMUST00000180952 2157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 AC159308.1-201ENSMUST00000216615 1351 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm44317-201ENSMUST00000204314 4214 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 4930524O08Rik-201ENSMUST00000183387 1451 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Tdrd1-204ENSMUST00000121249 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm37121-201ENSMUST00000192219 2556 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 AC153564.1-201ENSMUST00000217771 3607 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm44581-201ENSMUST00000206227 1693 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 0610030E20Rik-201ENSMUST00000077783 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm23030-201ENSMUST00000158004 273 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm23806-201ENSMUST00000175157 109 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm4617-201ENSMUST00000178993 331 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm26832-201ENSMUST00000181456 1282 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Trav6-4-202ENSMUST00000184650 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 1700110I07Rik-201ENSMUST00000205487 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 AC124778.1-201ENSMUST00000216013 162 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm5654-201ENSMUST00000217787 475 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Olfr447-201ENSMUST00000055763 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 n-R5s36-201ENSMUST00000082998 119 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms