Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Scgn-202ENSMUST00000142826 470 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 1700015C17Rik-201ENSMUST00000197297 239 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Gm44970-201ENSMUST00000206318 314 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Mpdz-216ENSMUST00000220807 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Trim66-203ENSMUST00000106741 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Prokr1-203ENSMUST00000204682 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Lyve1-201ENSMUST00000033050 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Scn3b-202ENSMUST00000114956 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Gm26888-201ENSMUST00000181119 3683 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Nfkbiz-203ENSMUST00000114457 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Tmcc3-202ENSMUST00000117460 3217 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Gm25782-201ENSMUST00000122526 289 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Gm16276-201ENSMUST00000131218 262 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Scarletltr-201ENSMUST00000176950 305 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 4933417G07Rik-202ENSMUST00000199732 964 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 AC126685.1-201ENSMUST00000221001 121 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Elmo2-205ENSMUST00000103091 4695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Olfr1394-202ENSMUST00000216273 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Xlr3a-202ENSMUST00000114524 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Pknox2-202ENSMUST00000080754 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Hcfc1-202ENSMUST00000114372 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 3830406C13Rik-206ENSMUST00000223762 2292 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Rrm1-201ENSMUST00000033283 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Gm12790-201ENSMUST00000106916 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Gm5260-201ENSMUST00000186157 949 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Gm34768-201ENSMUST00000193884 565 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Gm16571-202ENSMUST00000203839 585 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Gys2-201ENSMUST00000032371 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Olfr1426-204ENSMUST00000219005 2507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Tmem33-202ENSMUST00000160352 5322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Pfkfb1-202ENSMUST00000112713 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Nrip1-202ENSMUST00000121927 7868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Dgkh-204ENSMUST00000227767 3319 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 AC153143.2-201ENSMUST00000220999 1804 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Mccc1os-201ENSMUST00000124469 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Gm43392-201ENSMUST00000196560 434 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Gm45589-201ENSMUST00000209366 895 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Syne1-201ENSMUST00000041639 6990 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 1600015I10Rik-201ENSMUST00000031837 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Rbbp4-201ENSMUST00000102598 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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NischQ80TM9 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 4930404I05Rik-201ENSMUST00000125902 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Rtp4-201ENSMUST00000038423 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Myof-202ENSMUST00000172095 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Dbhos-201ENSMUST00000150024 4020 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Lamb3-202ENSMUST00000159955 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Myadm-204ENSMUST00000203566 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Stil-201ENSMUST00000030490 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Gm11581-201ENSMUST00000122024 763 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Gm27653-201ENSMUST00000185037 136 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 2610027F03Rik-201ENSMUST00000185443 530 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Olfr374-201ENSMUST00000209675 1053 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Tmprss11e-201ENSMUST00000161306 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Vtcn1-201ENSMUST00000054791 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Slc5a6-206ENSMUST00000202556 3078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 2610203C22Rik-204ENSMUST00000148585 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NischQ80TM9 AC155298.3-201ENSMUST00000225307 3220 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NischQ80TM9 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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