Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24057-201ENSMUST00000158616 302 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16297-201ENSMUST00000161466 459 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
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Ccdc88cQ6VGS5 Rttn-201ENSMUST00000023828 7268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
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Ccdc88cQ6VGS5 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
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Ccdc88cQ6VGS5 Map2-204ENSMUST00000114013 6258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
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Ccdc88cQ6VGS5 Narf-201ENSMUST00000103015 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
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Ccdc88cQ6VGS5 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
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Ccdc88cQ6VGS5 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17750-201ENSMUST00000182477 529 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27178-201ENSMUST00000184962 340 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7867-201ENSMUST00000189856 546 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37679-201ENSMUST00000192868 1192 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 AC116589.2-201ENSMUST00000220469 478 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Rapgef5-206ENSMUST00000222185 5508 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
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