Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Dubr-205ENSMUST00000191079 2105 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Zfp866-201ENSMUST00000131784 2680 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm10764-202ENSMUST00000220397 2335 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Prdm16-204ENSMUST00000105636 8426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gatad2b-205ENSMUST00000199754 7438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Impa1-201ENSMUST00000065938 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Pfkfb3-201ENSMUST00000028114 4712 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Slc12a3-201ENSMUST00000034218 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Igkv12-44-201ENSMUST00000103367 401 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm25916-201ENSMUST00000104263 131 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 n-R5s9-201ENSMUST00000104432 117 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm6798-201ENSMUST00000119961 360 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Olfr1274-ps-201ENSMUST00000120681 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm17091-201ENSMUST00000163248 357 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Sult3a2-201ENSMUST00000165904 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Vmn1r174-201ENSMUST00000167551 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Vmn1r173-201ENSMUST00000174055 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Rpl23a-ps7-201ENSMUST00000185437 460 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm28208-201ENSMUST00000185941 1157 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Frmd8os-202ENSMUST00000187697 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Scgb1b1-ps-201ENSMUST00000189264 268 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm6750-201ENSMUST00000189273 268 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm18181-201ENSMUST00000190670 736 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm7804-201ENSMUST00000192784 738 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm32569-201ENSMUST00000193955 604 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm37585-201ENSMUST00000195440 280 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 AI506816-203ENSMUST00000198461 503 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm40319-201ENSMUST00000199785 481 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm8921-201ENSMUST00000204306 649 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm18484-201ENSMUST00000204389 991 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm18559-201ENSMUST00000208249 604 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 AC160338.3-201ENSMUST00000214836 384 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm36719-201ENSMUST00000219518 927 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm9280-201ENSMUST00000223155 517 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Sult3a2-202ENSMUST00000223295 930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 AC126939.4-201ENSMUST00000225360 743 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 AC163295.1-201ENSMUST00000227840 314 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 CT009556.2-201ENSMUST00000227980 1123 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 AC118250.1-201ENSMUST00000228569 875 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Mgat4d-201ENSMUST00000038692 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Rpl27a-ps1-201ENSMUST00000075382 448 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Cyp2c50-202ENSMUST00000080171 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Mcm10-201ENSMUST00000027980 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm13108-201ENSMUST00000122287 1455 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm37549-201ENSMUST00000194096 4065 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Tdpoz1-201ENSMUST00000094413 2237 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Atxn7l1-213ENSMUST00000154742 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Ntsr1-201ENSMUST00000029084 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 AC153940.1-201ENSMUST00000220149 5300 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm37673-201ENSMUST00000194880 2451 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Olfr1471-205ENSMUST00000217482 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm35392-201ENSMUST00000209934 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 1700012E03Rik-201ENSMUST00000186237 1377 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Lsamp-202ENSMUST00000099761 8794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 C9-201ENSMUST00000022749 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm38339-201ENSMUST00000195479 1829 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Vmn1r44-212ENSMUST00000228183 1838 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm37065-203ENSMUST00000192498 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Lrtm1-202ENSMUST00000224708 1646 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Zkscan5-201ENSMUST00000031601 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Epn2-212ENSMUST00000178202 4317 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm37483-201ENSMUST00000194382 1484 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Fam161b-201ENSMUST00000021659 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Olfr410-202ENSMUST00000213831 5070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Entpd5-205ENSMUST00000120942 4881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm25593-201ENSMUST00000102272 96 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Igkv8-28-201ENSMUST00000103380 305 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Ccdc163-203ENSMUST00000106463 1159 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Dab1-201ENSMUST00000106826 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Borcs8-202ENSMUST00000110139 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm4596-201ENSMUST00000117197 442 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm12587-201ENSMUST00000120180 427 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm13877-201ENSMUST00000120614 417 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm9159-201ENSMUST00000120661 566 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm12517-201ENSMUST00000122082 425 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 4933427D06Rik-202ENSMUST00000153517 522 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm15389-201ENSMUST00000153774 666 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm12440-201ENSMUST00000155224 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm23207-201ENSMUST00000158665 102 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm3102-201ENSMUST00000164236 489 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm17064-201ENSMUST00000167690 452 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm17129-201ENSMUST00000168168 505 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm20500-201ENSMUST00000174621 321 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm16596-201ENSMUST00000180576 604 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Mlip-212ENSMUST00000184848 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 4930533D04Rik-201ENSMUST00000185478 788 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm8282-201ENSMUST00000187559 483 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm28239-201ENSMUST00000190225 447 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm43525-201ENSMUST00000196460 616 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm30613-201ENSMUST00000197277 512 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm18207-201ENSMUST00000205486 526 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 4930405G09Rik-201ENSMUST00000207912 1060 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm39121-201ENSMUST00000208847 525 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Olfr674-ps1-201ENSMUST00000209383 946 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 AC160338.2-201ENSMUST00000215508 281 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 AC118733.1-201ENSMUST00000217387 1217 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 4930455C13Rik-201ENSMUST00000218108 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 AC122905.1-201ENSMUST00000218181 456 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 4930551I15Rik-201ENSMUST00000219700 2143 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms