Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm9869-202ENSMUST00000214999 679 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Foxn3-201ENSMUST00000046859 7705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 AC115760.1-201ENSMUST00000225160 1327 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Ptpn3-201ENSMUST00000075637 6369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Siae-204ENSMUST00000215474 4947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Abi1-212ENSMUST00000153931 2729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Ccdc47-201ENSMUST00000002043 5193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Meis1-201ENSMUST00000068264 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Grik2-201ENSMUST00000079751 2610 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Wdr72-201ENSMUST00000055879 5196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 4833420G17Rik-203ENSMUST00000224312 3406 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm15763-201ENSMUST00000120136 403 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm16249-201ENSMUST00000124055 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Spata3-203ENSMUST00000125083 704 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm15963-201ENSMUST00000131387 876 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Olfr290-201ENSMUST00000073468 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Olfr401-201ENSMUST00000079827 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Csf3r-201ENSMUST00000030673 3160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Alms1-201ENSMUST00000072018 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Grik1-202ENSMUST00000072256 3655 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Tssk1-201ENSMUST00000046937 3700 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm36401-201ENSMUST00000194255 2028 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Serpinb9-201ENSMUST00000006391 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Zfp142-202ENSMUST00000066986 5756 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Cysltr2-201ENSMUST00000044664 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm11821-201ENSMUST00000117335 979 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm5406-201ENSMUST00000120054 766 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm2040-201ENSMUST00000202979 289 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm44163-201ENSMUST00000205140 475 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Rpl31-ps17-201ENSMUST00000097040 378 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Ttc9c-202ENSMUST00000096751 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Wdr76-203ENSMUST00000110602 4170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Zfp641-202ENSMUST00000169721 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Txk-201ENSMUST00000113604 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Vmn1r26-203ENSMUST00000228070 4419 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Vmn1r70-204ENSMUST00000228090 3185 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 A730036I17Rik-201ENSMUST00000143346 3431 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Kif1a-204ENSMUST00000171796 8206 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Ddx6-203ENSMUST00000217034 6029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm5125-201ENSMUST00000148614 624 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm26169-201ENSMUST00000158420 135 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Glipr1-204ENSMUST00000162508 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm23450-201ENSMUST00000178285 91 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm2602-201ENSMUST00000202112 571 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm45391-201ENSMUST00000211563 576 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 AC154324.1-201ENSMUST00000226711 814 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Lamb3-202ENSMUST00000159955 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Zbtb18-201ENSMUST00000077225 4944 ntAPPRIS P3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Arhgap12-212ENSMUST00000182559 4265 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Nrp2-206ENSMUST00000114157 6357 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Nckap5-208ENSMUST00000161954 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm26849-201ENSMUST00000180561 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc18Q640L5 Gm15114-201ENSMUST00000112788 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms