Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm37148-201ENSMUST00000195097 716 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm7554-201ENSMUST00000202282 574 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Olfr1079-201ENSMUST00000099882 948 ntAPPRIS P2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gpr165-201ENSMUST00000033554 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Wipf3-205ENSMUST00000163746 4102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Arel1-201ENSMUST00000043169 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
AtmQ62388 R3hdm2-202ENSMUST00000077046 4029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Pnisr-201ENSMUST00000029911 4545 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
AtmQ62388 9330136K24Rik-201ENSMUST00000180842 2478 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Ttll4-202ENSMUST00000113678 3762 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Medag-202ENSMUST00000201083 2669 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm12959-201ENSMUST00000119396 403 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm34474-201ENSMUST00000209645 356 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Olfr975-202ENSMUST00000216647 2848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Efl1-205ENSMUST00000179489 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Efl1-201ENSMUST00000039881 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
AtmQ62388 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Cspg4-201ENSMUST00000035661 8121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
AtmQ62388 R3hdm2-201ENSMUST00000064793 4175 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Prkaa2-201ENSMUST00000030243 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Snhg17-209ENSMUST00000186993 3144 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm8728-201ENSMUST00000207367 2178 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm8486-201ENSMUST00000207508 2171 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm8685-201ENSMUST00000207567 2183 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm16443-201ENSMUST00000207909 2184 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Arnt2-207ENSMUST00000208232 6047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Dnmt1-202ENSMUST00000177754 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm4767-202ENSMUST00000188096 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Tpx2-202ENSMUST00000109816 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm37552-201ENSMUST00000193939 2520 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Olfr1146-ps1-201ENSMUST00000117180 943 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm13890-201ENSMUST00000117578 390 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm36993-201ENSMUST00000192983 2980 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
AtmQ62388 AC153800.1-201ENSMUST00000219212 365 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
AtmQ62388 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
AtmQ62388 1520401A03Rik-204ENSMUST00000178006 3726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Zfp661-201ENSMUST00000077422 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Nyap2-205ENSMUST00000137862 3393 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Tank-202ENSMUST00000112494 2698 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm37216-201ENSMUST00000193817 3478 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm13702-201ENSMUST00000118542 825 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm37203-201ENSMUST00000191618 385 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
AtmQ62388 1700109H08Rik-201ENSMUST00000008451 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
AtmQ62388 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Trim30b-204ENSMUST00000164410 3042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Dusp3-201ENSMUST00000003612 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
AtmQ62388 A330015K06Rik-201ENSMUST00000195489 4286 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
AtmQ62388 Rrp8-202ENSMUST00000098148 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
AtmQ62388 Olfr1198-203ENSMUST00000215529 3413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.36
AtmQ62388 Scn8a-213ENSMUST00000201549 7120 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
AtmQ62388 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
AtmQ62388 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
AtmQ62388 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
AtmQ62388 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
AtmQ62388 Gm6446-201ENSMUST00000120604 818 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms