Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm7368-201ENSMUST00000213307 367 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Q3U6N9 AC113204.1-203ENSMUST00000219475 375 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Q3U6N9 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Hipk2-205ENSMUST00000160962 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Rufy3-201ENSMUST00000031229 4049 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Carf-206ENSMUST00000180952 2157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Stox2-202ENSMUST00000110367 3424 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Pknox2-202ENSMUST00000080754 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Ctnna2-202ENSMUST00000159626 3908 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Parp8-201ENSMUST00000022239 3098 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm37283-201ENSMUST00000193111 1571 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Cyp2c44-202ENSMUST00000211830 1557 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Cbll1-202ENSMUST00000085487 1332 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Cpb1-201ENSMUST00000011607 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Folh1-201ENSMUST00000001824 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Vmn2r-ps26-201ENSMUST00000202039 2111 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Q3U6N9 AC105958.1-201ENSMUST00000214783 2144 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Q3U6N9 AC130219.1-201ENSMUST00000228406 3433 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Dach2-203ENSMUST00000113379 2512 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Olfr212-201ENSMUST00000075756 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm37611-201ENSMUST00000195250 2028 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Slc5a6-206ENSMUST00000202556 3078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Lnpep-201ENSMUST00000041047 5181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Mep1a-202ENSMUST00000117137 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Tbx20-201ENSMUST00000052946 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Krr1-203ENSMUST00000163048 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm22438-201ENSMUST00000104049 132 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm22671-201ENSMUST00000104420 134 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm13798-201ENSMUST00000118285 139 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
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Q3U6N9 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Q3U6N9 Gm15275-201ENSMUST00000154752 347 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
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Q3U6N9 Gm34144-201ENSMUST00000197039 259 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm7285-201ENSMUST00000198801 580 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm44287-201ENSMUST00000203069 290 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm43928-201ENSMUST00000203737 409 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Pde6h-203ENSMUST00000204382 211 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Q3U6N9 Mpzl3-203ENSMUST00000114664 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Q3U6N9 Gm20597-201ENSMUST00000218774 5486 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Q3U6N9 Olfr1508-202ENSMUST00000206520 5791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Q3U6N9 Prox2-202ENSMUST00000177289 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Rtp4-201ENSMUST00000038423 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Scn11a-201ENSMUST00000070617 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Q3U6N9 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Q3U6N9 Gm44769-201ENSMUST00000206120 2809 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
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Q3U6N9 Cyhr1-202ENSMUST00000081291 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Angpt2-201ENSMUST00000033846 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Ampd3-208ENSMUST00000213373 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Zfp655-205ENSMUST00000199322 4157 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gpm6b-202ENSMUST00000112223 4764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Pex5l-211ENSMUST00000194016 4206 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Adhfe1-203ENSMUST00000144177 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Ugt3a1-201ENSMUST00000022861 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Chrm2-202ENSMUST00000172278 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm33027-201ENSMUST00000206093 4664 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Stra6l-203ENSMUST00000107783 3669 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm44289-201ENSMUST00000204144 1390 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm16973-202ENSMUST00000180752 1972 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Golgb1-202ENSMUST00000039855 10847 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Taf1-206ENSMUST00000149274 5954 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm26419-201ENSMUST00000104272 133 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
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