Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Cst11-201ENSMUST00000028934 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Olfr609-201ENSMUST00000055787 965 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Olfr1262-201ENSMUST00000061701 1024 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Adgrg4-201ENSMUST00000096431 1137 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm6787-201ENSMUST00000123120 1454 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Rfc1-201ENSMUST00000172732 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm6640-201ENSMUST00000120629 1587 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm44093-201ENSMUST00000204381 1802 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Olfr417-202ENSMUST00000217962 5662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gpr119-201ENSMUST00000053970 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Mbd5-202ENSMUST00000112745 6037 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Cacna1e-203ENSMUST00000187541 14921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm18259-201ENSMUST00000220991 2010 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Il1rl1-201ENSMUST00000053043 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Anxa1-201ENSMUST00000025561 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 AC153512.1-201ENSMUST00000218961 1603 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm24986-201ENSMUST00000104452 132 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 9630041A04Rik-201ENSMUST00000112841 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Smarca2-204ENSMUST00000175791 946 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 1700028D13Rik-202ENSMUST00000187272 675 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm37260-201ENSMUST00000193748 1251 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm9497-201ENSMUST00000199908 538 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 4930563J15Rik-202ENSMUST00000219752 560 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Olfr715-201ENSMUST00000076958 1131 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Ndufa9-201ENSMUST00000088194 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 4930428E07Rik-202ENSMUST00000222922 3799 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Plch1-203ENSMUST00000084105 6245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Bdnf-211ENSMUST00000176893 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Myrfl-201ENSMUST00000048229 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Tph1-201ENSMUST00000049298 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm26876-201ENSMUST00000180875 2387 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm44553-201ENSMUST00000206316 2037 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm37321-201ENSMUST00000195742 1872 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 3830408C21Rik-202ENSMUST00000223895 1689 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Mapk10-203ENSMUST00000112847 7196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm16506-201ENSMUST00000165553 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Golgb1-203ENSMUST00000114812 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm22470-201ENSMUST00000104117 130 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm14745-201ENSMUST00000118480 1096 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Hnf1aos1-203ENSMUST00000131845 740 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm25770-201ENSMUST00000158566 115 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm18709-201ENSMUST00000180564 489 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm45764-201ENSMUST00000213047 571 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 AC158518.1-201ENSMUST00000216435 320 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 4930466K18Rik-201ENSMUST00000219458 906 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Olfr1494-201ENSMUST00000051768 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Cbx3-202ENSMUST00000094623 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm17199-201ENSMUST00000097296 416 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Unc13b-215ENSMUST00000207569 14754 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Ctage5-208ENSMUST00000175877 2612 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Gjb2Q00977 Gm34777-201ENSMUST00000219688 2505 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Gjb2Q00977 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Gjb2Q00977 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Gjb2Q00977 AI506816-205ENSMUST00000199941 2804 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gjb2Q00977 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gjb2Q00977 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gjb2Q00977 Gm28515-201ENSMUST00000189823 2530 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gjb2Q00977 Gm18830-201ENSMUST00000199036 1396 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Gjb2Q00977 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gjb2Q00977 Igkv4-81-201ENSMUST00000103340 290 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms