Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm9381-201ENSMUST00000182285 1012 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Mir7029-201ENSMUST00000184777 61 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm27238-201ENSMUST00000185180 417 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm4785-201ENSMUST00000191025 751 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm36928-201ENSMUST00000192466 694 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm37294-201ENSMUST00000193461 494 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm29999-202ENSMUST00000193554 671 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm37325-201ENSMUST00000194971 694 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm20223-201ENSMUST00000199932 805 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm35520-201ENSMUST00000209235 784 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm45509-201ENSMUST00000209624 1229 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm38430-201ENSMUST00000209888 1240 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Ccl7-201ENSMUST00000021011 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Olfr1345-ps1-201ENSMUST00000210627 244 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm45463-202ENSMUST00000210735 1188 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm8804-201ENSMUST00000212292 798 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Olfr221-203ENSMUST00000214342 1062 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm32443-201ENSMUST00000217880 707 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 AV026068-229ENSMUST00000225516 595 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Olfr1265-201ENSMUST00000080311 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 n-R5s156-201ENSMUST00000083377 105 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Adgrg4-201ENSMUST00000096431 1137 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Olfr1269-201ENSMUST00000099756 1018 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Hspg2-201ENSMUST00000030547 14187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Brd8-202ENSMUST00000097626 3005 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Klb-201ENSMUST00000031096 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Tssc1-206ENSMUST00000221877 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm45807-201ENSMUST00000209142 2874 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Olfr1-201ENSMUST00000120303 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Nup93-202ENSMUST00000109547 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm37364-201ENSMUST00000192533 3920 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Ugt1a6b-201ENSMUST00000113137 2249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Celf5-204ENSMUST00000120856 3861 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm37877-201ENSMUST00000191630 2709 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm29226-201ENSMUST00000186871 2167 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm38200-201ENSMUST00000192083 2111 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Slc7a2-204ENSMUST00000118432 3681 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Apobec4-201ENSMUST00000068875 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Ahi1-202ENSMUST00000163505 2067 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Fbxw7-202ENSMUST00000107675 3599 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Larp1b-201ENSMUST00000026862 1541 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Etv1-203ENSMUST00000160244 2032 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Cpeb4-202ENSMUST00000109412 6303 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Cdh16-204ENSMUST00000211903 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm16506-201ENSMUST00000165553 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Txndc16-207ENSMUST00000147853 2816 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm42692-201ENSMUST00000199482 2833 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Zfp641-202ENSMUST00000169721 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Zscan18-203ENSMUST00000210650 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Grik1-210ENSMUST00000228034 2708 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Prg4-203ENSMUST00000111902 3636 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Alkbh8-201ENSMUST00000053407 3603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm6185-202ENSMUST00000212885 2692 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Tctex1d1-202ENSMUST00000116317 1772 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm25083-201ENSMUST00000102319 92 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Trappc1-202ENSMUST00000102601 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Bdnf-203ENSMUST00000111043 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm12331-201ENSMUST00000119927 622 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm14097-201ENSMUST00000147868 470 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Rps29P62274 Gm26182-201ENSMUST00000157688 116 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms