Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gm20547-202ENSMUST00000146299 3893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Olfr314-202ENSMUST00000205189 2647 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Eya3-201ENSMUST00000020197 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd1P40201 AC107740.1-201ENSMUST00000216972 2401 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Carf-206ENSMUST00000180952 2157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd1P40201 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd1P40201 AC158605.4-201ENSMUST00000219013 3361 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Dido1-206ENSMUST00000103057 4906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm44669-201ENSMUST00000207774 1969 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gstm7-202ENSMUST00000106687 743 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd1P40201 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm37920-201ENSMUST00000192952 749 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm44239-201ENSMUST00000204228 271 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd1P40201 AC154718.1-201ENSMUST00000226676 250 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Katnal1-201ENSMUST00000047257 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Pantr1-208ENSMUST00000181660 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Tcf7l2-211ENSMUST00000111658 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Zfp52-201ENSMUST00000079242 2175 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chd1P40201 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Tssk1-201ENSMUST00000046937 3700 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Chd1P40201 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm28140-201ENSMUST00000190148 1271 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm37974-201ENSMUST00000193668 220 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chd1P40201 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Chd1P40201 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chd1P40201 AC154270.2-201ENSMUST00000226755 2306 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Cntrl-206ENSMUST00000113037 5970 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Vrk1-203ENSMUST00000085026 3711 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm38056-201ENSMUST00000193928 5027 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chd1P40201 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Serinc3-201ENSMUST00000017851 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Adgrf4-204ENSMUST00000170723 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Ralgps1-204ENSMUST00000113165 6192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm37956-201ENSMUST00000195208 2010 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Ankrd27-206ENSMUST00000190503 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chd1P40201 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm7970-201ENSMUST00000167615 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm8229-201ENSMUST00000168161 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Sgsh-201ENSMUST00000005173 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm12107-201ENSMUST00000132857 889 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm3266-201ENSMUST00000217832 591 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm5514-201ENSMUST00000060477 306 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Kdm5a-201ENSMUST00000005108 10944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm38299-201ENSMUST00000193214 3789 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Il1rap-203ENSMUST00000166294 3200 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm16487-201ENSMUST00000105048 4037 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm42444-201ENSMUST00000199366 4558 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Lmbrd1-206ENSMUST00000191471 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Srek1ip1-201ENSMUST00000022230 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Trav14n-3-201ENSMUST00000103635 280 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm25824-201ENSMUST00000157092 121 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm22599-201ENSMUST00000157597 132 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Frmd8os-202ENSMUST00000187697 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm37375-201ENSMUST00000193859 387 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm37385-201ENSMUST00000195223 387 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Chd1P40201 2900002M20Rik-201ENSMUST00000195754 330 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm43798-201ENSMUST00000202056 394 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Rpl7a-ps14-201ENSMUST00000205097 790 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm18467-201ENSMUST00000208805 434 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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