Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm14945-201ENSMUST00000119556 1118 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Gm11991-201ENSMUST00000119652 1074 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Mup-ps22-201ENSMUST00000121611 243 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Gm15488-201ENSMUST00000121682 670 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Gm15230-201ENSMUST00000153701 510 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Gm23079-201ENSMUST00000157847 117 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 4930526L06Rik-201ENSMUST00000181137 1022 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Gm10267-202ENSMUST00000181652 341 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Gm28918-201ENSMUST00000188822 699 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Gm29562-201ENSMUST00000190113 904 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Gm37883-201ENSMUST00000194970 725 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Scn8a-207ENSMUST00000200959 587 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Olfr320-201ENSMUST00000204718 928 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Gm45912-201ENSMUST00000210646 543 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 AC120383.1-201ENSMUST00000221123 573 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Gm9249-201ENSMUST00000221420 578 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 AC154635.1-201ENSMUST00000221433 400 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 AL590616.1-201ENSMUST00000223339 574 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 AC162183.1-201ENSMUST00000224843 472 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 AC099612.2-201ENSMUST00000226824 721 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 AC139845.2-201ENSMUST00000227504 436 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Ifitm5-201ENSMUST00000026562 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Frmd7-201ENSMUST00000060650 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Commd3-201ENSMUST00000061158 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Gm10247-201ENSMUST00000090395 333 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Olfr1101-201ENSMUST00000099870 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Olfr97-204ENSMUST00000214622 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Olfr97-201ENSMUST00000073667 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Ergic2-208ENSMUST00000136008 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Lmx1a-201ENSMUST00000028003 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Gm45056-201ENSMUST00000208140 3462 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Calb1-201ENSMUST00000029876 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Btbd18-201ENSMUST00000133437 3052 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Gm7869-201ENSMUST00000121457 1322 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Lpin1-207ENSMUST00000222989 4103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Gm6787-201ENSMUST00000123120 1454 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Nasp-203ENSMUST00000081182 1461 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 AC124581.3-201ENSMUST00000224270 1624 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Gm3476-202ENSMUST00000167913 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Olfr1462-202ENSMUST00000208533 3424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Rnf222-201ENSMUST00000065213 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Gcsam-201ENSMUST00000023339 3315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 AC126251.1-201ENSMUST00000228170 2707 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Olfr1241-203ENSMUST00000215055 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Gm45634-201ENSMUST00000209736 1990 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Gm19031-201ENSMUST00000176280 1365 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 AC124426.1-203ENSMUST00000221814 1362 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Gas2l3-201ENSMUST00000099374 6748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Klrb1c-201ENSMUST00000167691 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Cyld-203ENSMUST00000109626 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Rnf144b-202ENSMUST00000110111 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Gtf3c2-210ENSMUST00000202639 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 1110002E22Rik-201ENSMUST00000163080 9741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Tmc2-202ENSMUST00000166774 2667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Gm10513-201ENSMUST00000194203 6468 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Entpd5-201ENSMUST00000021662 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Ear1-201ENSMUST00000100691 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Gm12931-201ENSMUST00000117046 324 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Mageb16-ps1-201ENSMUST00000117991 1127 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Gm12642-201ENSMUST00000121098 876 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Gm13828-201ENSMUST00000122278 363 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Olfr1134-202ENSMUST00000135875 1291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Gm24130-201ENSMUST00000158536 151 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Gm10804-202ENSMUST00000162565 867 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Gm21971-201ENSMUST00000180187 337 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 4930426I24Rik-201ENSMUST00000180709 601 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Gm26895-201ENSMUST00000181295 619 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Gm4221-201ENSMUST00000181538 1232 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Gm29143-201ENSMUST00000189462 201 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Gm28986-201ENSMUST00000189682 678 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Gm29459-201ENSMUST00000191359 518 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Gm37059-201ENSMUST00000191723 678 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Gm38305-201ENSMUST00000194825 223 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Gm38343-201ENSMUST00000195786 1060 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 C78283-201ENSMUST00000202711 848 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Klra13-ps-203ENSMUST00000204367 850 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Gm45509-201ENSMUST00000209624 1229 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Gm19233-201ENSMUST00000219772 936 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 AC154785.1-201ENSMUST00000223280 572 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 AC113031.2-201ENSMUST00000226132 579 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 CT009539.1-201ENSMUST00000226465 220 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Olfr648-201ENSMUST00000052659 951 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Xlr4a-201ENSMUST00000078775 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Reg1-201ENSMUST00000079926 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Rps6ka6-201ENSMUST00000065976 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Musk-201ENSMUST00000081919 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Zfp521-201ENSMUST00000025288 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Olfr305-203ENSMUST00000213869 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Ano3-201ENSMUST00000099623 6705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Vmn1r51-204ENSMUST00000226977 4357 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Mars2-201ENSMUST00000061334 11294 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Cdc14b-202ENSMUST00000109769 2886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Chrnb4-201ENSMUST00000034854 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Il15ra-217ENSMUST00000148748 1542 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Plscr2-201ENSMUST00000034932 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Nedd1P33215 Tdrkh-204ENSMUST00000196606 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms