Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Olfr1128-201ENSMUST00000102624 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm15576-201ENSMUST00000117806 583 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm14016-201ENSMUST00000119095 486 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm15665-201ENSMUST00000119116 847 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm10639-201ENSMUST00000119823 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm15392-201ENSMUST00000152863 778 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 Zfp652os-201ENSMUST00000155531 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 Vwc2l-204ENSMUST00000162182 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 Dctd-205ENSMUST00000174278 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 Olfr318-201ENSMUST00000189911 1026 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm28341-201ENSMUST00000190883 472 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm17965-201ENSMUST00000193904 517 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm31579-201ENSMUST00000203306 966 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm4780-201ENSMUST00000213206 1242 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm7392-201ENSMUST00000217815 345 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 4930477G07Rik-202ENSMUST00000223195 947 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 AC110176.1-201ENSMUST00000226219 504 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 Cd74-201ENSMUST00000050487 1218 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 Tmem69-201ENSMUST00000069674 974 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 Rps12-ps3-201ENSMUST00000086764 494 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm10354-201ENSMUST00000096953 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 Ifit3-201ENSMUST00000102825 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 Mef2c-228ENSMUST00000199450 2862 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 Mmp10-201ENSMUST00000034488 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm28431-201ENSMUST00000185592 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 Hmg20a-201ENSMUST00000034879 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 Olfr60-202ENSMUST00000210932 2383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 Lrrtm3-201ENSMUST00000105439 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm7982-201ENSMUST00000101011 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm6351-201ENSMUST00000101021 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 Polk-210ENSMUST00000222389 1404 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm7682-201ENSMUST00000098289 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
RxraP28700 Magea10-201ENSMUST00000088481 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC7.34□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC7.34□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
RxraP28700 2810414N06Rik-201ENSMUST00000186444 1381 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 C230079O03Rik-201ENSMUST00000209560 1385 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 Slc17a3-202ENSMUST00000091698 1759 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 Scd1-201ENSMUST00000041331 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 Olfr305-203ENSMUST00000213869 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 Kmo-201ENSMUST00000040250 2695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 Trmt10b-201ENSMUST00000044673 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 Crtam-202ENSMUST00000180384 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm20877-201ENSMUST00000100105 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 Borcs8-202ENSMUST00000110139 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 Cav1-205ENSMUST00000115456 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm12344-201ENSMUST00000117087 329 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 Defa-ps7-201ENSMUST00000117139 168 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm7831-201ENSMUST00000117990 552 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm11259-201ENSMUST00000120554 715 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm11688-201ENSMUST00000122145 308 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm13175-201ENSMUST00000139479 466 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm5611-201ENSMUST00000164523 852 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm20797-201ENSMUST00000177894 383 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 2610034O05Rik-201ENSMUST00000194078 855 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm37223-206ENSMUST00000195070 699 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm43590-201ENSMUST00000195987 387 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm7285-201ENSMUST00000198801 580 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm43558-201ENSMUST00000200155 210 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm32816-202ENSMUST00000206497 496 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm44508-201ENSMUST00000206943 1157 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 Smarca2-238ENSMUST00000208589 1054 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 BC024386-202ENSMUST00000209496 851 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 AC158518.1-201ENSMUST00000216435 320 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 AC159542.1-201ENSMUST00000218201 450 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 7420701I03Rik-201ENSMUST00000222157 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm5374-202ENSMUST00000222910 314 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm24046-201ENSMUST00000083111 165 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 Cdc42-201ENSMUST00000030417 1448 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 AC131667.1-201ENSMUST00000214665 2175 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 Fam193a-201ENSMUST00000094867 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 4921525O09Rik-201ENSMUST00000220691 3270 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm6767-201ENSMUST00000118650 1381 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
RxraP28700 AC154368.2-201ENSMUST00000222334 1724 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
RxraP28700 Myot-202ENSMUST00000115498 2087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms