Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Gm43647-201ENSMUST00000198142 486 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gm43069-201ENSMUST00000201006 859 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gm44196-202ENSMUST00000204186 812 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gm45155-201ENSMUST00000207365 596 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gm45343-201ENSMUST00000210452 828 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gm33838-201ENSMUST00000214038 786 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 AC154296.3-201ENSMUST00000214427 712 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 AC158799.1-201ENSMUST00000214686 617 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gm33053-201ENSMUST00000215275 1144 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gm18112-201ENSMUST00000219862 1195 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gm32834-202ENSMUST00000222417 655 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Zfp637-211ENSMUST00000223041 1128 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 AC154843.1-201ENSMUST00000226897 1138 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 AC154760.1-201ENSMUST00000227218 673 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 1700009N14Rik-201ENSMUST00000029955 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Tmem213-201ENSMUST00000031851 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gstm5-201ENSMUST00000004134 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Olfr1489-201ENSMUST00000053113 1111 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Pcdh17-201ENSMUST00000071370 11451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gm9761-201ENSMUST00000075650 492 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Tas2r138-201ENSMUST00000076565 996 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gm22043-201ENSMUST00000082993 158 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Zfp940-201ENSMUST00000085792 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Spata22-202ENSMUST00000092926 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Olfr1055-201ENSMUST00000099894 1182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Mbtd1-205ENSMUST00000107853 5245 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Nlgn3-202ENSMUST00000118111 8004 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Elf5-201ENSMUST00000028609 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gm18639-201ENSMUST00000210442 1769 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gm6011-201ENSMUST00000211736 1796 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Drp2-203ENSMUST00000113226 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 3110009F21Rik-201ENSMUST00000223217 1625 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gm4907-201ENSMUST00000116614 1493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Zfp758-204ENSMUST00000149699 2876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Itgb1bp2-201ENSMUST00000033674 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 AC135669.2-201ENSMUST00000215636 4958 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 CT010505.3-201ENSMUST00000227835 1651 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Tmem173-201ENSMUST00000115728 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 E230015B07Rik-202ENSMUST00000159884 2822 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Panct2-201ENSMUST00000181489 3849 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Olfr1393-202ENSMUST00000213323 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 4930442J19Rik-202ENSMUST00000157058 1721 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Olfr54-203ENSMUST00000217480 5048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Hfe-202ENSMUST00000091706 3572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gatad2b-204ENSMUST00000199607 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Mrgprx2-202ENSMUST00000186394 1930 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Supt20-203ENSMUST00000197502 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Pde4b-204ENSMUST00000106901 2129 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Sult2a7-201ENSMUST00000108524 897 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gm13352-201ENSMUST00000117515 262 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 AI662270-201ENSMUST00000142709 304 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gm12371-201ENSMUST00000144029 1091 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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PdgfaP20033 Slc15a2-205ENSMUST00000164579 1068 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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PdgfaP20033 Gm21762-201ENSMUST00000177561 456 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
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PdgfaP20033 2310008N11Rik-202ENSMUST00000210263 422 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Sult2a7-204ENSMUST00000211740 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 AC153729.2-201ENSMUST00000215166 560 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gm39329-201ENSMUST00000215849 798 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gm33929-201ENSMUST00000221762 367 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 CT485612.3-201ENSMUST00000222179 408 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 AC161252.2-201ENSMUST00000224978 374 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 AC167013.3-201ENSMUST00000228110 989 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
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PdgfaP20033 Olfr514-201ENSMUST00000084754 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
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PdgfaP20033 Olfr606-201ENSMUST00000098200 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Olfr466-202ENSMUST00000214214 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Nol4-202ENSMUST00000081423 3309 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 4933402E13Rik-201ENSMUST00000051414 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Cd36-203ENSMUST00000169095 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Ceacam1-202ENSMUST00000098668 1478 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Amot-201ENSMUST00000112835 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Hipk1-203ENSMUST00000118317 7939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Osbpl9-201ENSMUST00000030288 2871 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Emsy-201ENSMUST00000038359 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Olfr1299-201ENSMUST00000207228 1678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PdgfaP20033 Gm28055-202ENSMUST00000189576 1301 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
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