Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Olfr329-ps-202ENSMUST00000108823 1060 ntAPPRIS P2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Lypd8-202ENSMUST00000108826 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm12310-201ENSMUST00000118013 492 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm12955-201ENSMUST00000119689 957 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Olfr1274-ps-201ENSMUST00000120681 1035 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm14048-201ENSMUST00000121864 1268 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm8865-201ENSMUST00000125697 430 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Olfr636-ps1-201ENSMUST00000134827 935 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Crem-229ENSMUST00000151084 957 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Mcpt2-201ENSMUST00000015576 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Slc15a2-212ENSMUST00000168279 958 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm25082-201ENSMUST00000177296 255 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm6931-201ENSMUST00000183103 371 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm29243-201ENSMUST00000188318 418 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm38143-201ENSMUST00000191751 644 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm37560-201ENSMUST00000194289 1000 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm37223-206ENSMUST00000195070 699 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm37929-201ENSMUST00000195116 493 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Ighv10-2-201ENSMUST00000195182 298 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm42667-201ENSMUST00000196132 234 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Zc2hc1b-201ENSMUST00000019954 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Cyb5r2-202ENSMUST00000208217 1178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm8804-201ENSMUST00000212292 798 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 AC133948.1-201ENSMUST00000214867 599 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 AC122188.1-201ENSMUST00000217534 312 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 CT033774.2-201ENSMUST00000222079 256 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 AC163038.1-201ENSMUST00000223632 1142 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 AC123058.1-201ENSMUST00000223748 437 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm5590-201ENSMUST00000059110 345 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Fabp3-ps1-201ENSMUST00000070435 402 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Olfr1491-202ENSMUST00000214007 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Olfr1491-203ENSMUST00000215493 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Olfr1491-205ENSMUST00000216377 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm38302-201ENSMUST00000191676 2076 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm11934-201ENSMUST00000132553 1536 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm15462-201ENSMUST00000133653 4580 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Carf-206ENSMUST00000180952 2157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Pdzd9-201ENSMUST00000033178 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Odam-202ENSMUST00000129757 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm20539-201ENSMUST00000174811 1384 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Slc22a26-201ENSMUST00000065634 2007 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Olfr212-202ENSMUST00000218028 2291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Ubr4-201ENSMUST00000097822 15928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm6679-201ENSMUST00000191467 1869 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Ftmt-201ENSMUST00000025388 1451 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm21036-201ENSMUST00000207544 2611 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Olfr432-203ENSMUST00000213381 4533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Lrrtm3-201ENSMUST00000105439 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Abi1-212ENSMUST00000153931 2729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 AI838599-201ENSMUST00000133960 2953 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Fcgr3-201ENSMUST00000164044 1347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Schip1-207ENSMUST00000182997 1557 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm28649-201ENSMUST00000189153 1581 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Lum-201ENSMUST00000038160 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 1700095J07Rik-201ENSMUST00000128017 1405 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm20707-201ENSMUST00000176201 2516 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Ccdc170-202ENSMUST00000138112 3350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Fam49a-205ENSMUST00000223061 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Il15ra-217ENSMUST00000148748 1542 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Mir711-201ENSMUST00000102188 82 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Mir290a-201ENSMUST00000104627 83 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Smpx-203ENSMUST00000112521 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm5915-201ENSMUST00000116136 454 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm12692-201ENSMUST00000121092 546 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 9530026F06Rik-201ENSMUST00000141000 892 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Nup37-202ENSMUST00000169309 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm17157-201ENSMUST00000172397 348 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm24824-201ENSMUST00000175097 78 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Vmn2r-ps31-201ENSMUST00000176474 760 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Mir5623-201ENSMUST00000176631 70 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm3002-202ENSMUST00000178256 444 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm2974-202ENSMUST00000180184 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm29491-201ENSMUST00000189481 506 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Cnih4-205ENSMUST00000193907 531 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm37450-201ENSMUST00000195218 170 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm43647-201ENSMUST00000198142 486 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm3279-201ENSMUST00000203099 1092 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm44508-201ENSMUST00000206943 1157 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm44983-201ENSMUST00000208121 463 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms