Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Gm20813-201ENSMUST00000186646 705 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm28142-201ENSMUST00000186899 698 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm21923-201ENSMUST00000188455 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm20917-202ENSMUST00000188706 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm9497-201ENSMUST00000199908 538 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 1500002F19Rik-203ENSMUST00000211184 375 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 CT030166.4-201ENSMUST00000220640 404 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 AC154487.1-201ENSMUST00000224649 226 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 AC159205.1-201ENSMUST00000225513 1099 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 AC138604.2-201ENSMUST00000226620 921 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 CT009556.4-201ENSMUST00000227092 200 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Rpsa-ps2-201ENSMUST00000059546 880 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Olfr1322-201ENSMUST00000070304 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Olfr715-201ENSMUST00000076958 1131 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Rpl31-ps20-201ENSMUST00000080982 378 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Olfr224-201ENSMUST00000081102 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm22504-201ENSMUST00000082963 139 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm17199-201ENSMUST00000097296 416 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Olfr666-202ENSMUST00000214757 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm26575-201ENSMUST00000181714 2232 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 9530036M11Rik-201ENSMUST00000138767 1996 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Pramef20-201ENSMUST00000121109 1434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm42653-201ENSMUST00000200644 2839 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Cyp2c66-201ENSMUST00000087234 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Olfr1038-ps-202ENSMUST00000216665 4530 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Zbtb38-201ENSMUST00000093798 4091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm25614-201ENSMUST00000104013 133 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Mageb8-ps-201ENSMUST00000117228 1033 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm27373-201ENSMUST00000184017 184 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 AV026068-205ENSMUST00000186386 762 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 1700028D13Rik-202ENSMUST00000187272 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm28535-201ENSMUST00000188069 885 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm36945-201ENSMUST00000192040 864 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm42823-201ENSMUST00000197975 256 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm8921-201ENSMUST00000204306 649 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Olfr706-201ENSMUST00000209025 1087 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Olfr221-203ENSMUST00000214342 1062 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 AC159542.1-201ENSMUST00000218201 450 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 CT030182.4-201ENSMUST00000223647 645 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 AV026068-219ENSMUST00000224148 933 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 1700123O20Rik-203ENSMUST00000227269 893 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 AC154838.3-201ENSMUST00000228876 965 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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Ifnb1P01575 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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Ifnb1P01575 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm36527-201ENSMUST00000195500 3029 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Pank1-202ENSMUST00000112460 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Sec24c-202ENSMUST00000223751 4196 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 A830010M20Rik-204ENSMUST00000112671 6756 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Asxl2-201ENSMUST00000092003 11934 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Clrn1-202ENSMUST00000055636 3083 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 9530086O07Rik-201ENSMUST00000203503 2685 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
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Ifnb1P01575 AC163660.4-201ENSMUST00000224983 2171 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm36814-201ENSMUST00000197457 1755 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Tmem87a-203ENSMUST00000110729 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm1587-201ENSMUST00000100372 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm24986-201ENSMUST00000104452 132 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm8916-201ENSMUST00000119732 949 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm11371-201ENSMUST00000120294 385 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Olfr1017-ps1-201ENSMUST00000121263 664 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Sh3d2c-ps1-201ENSMUST00000121498 904 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm12484-201ENSMUST00000156311 581 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Gm24647-201ENSMUST00000157112 113 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ifnb1P01575 Scgb1b28-ps-201ENSMUST00000163647 290 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms