Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Gm44374-201ENSMUST00000199821 140 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 4930567H12Rik-201ENSMUST00000212260 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Gm18789-201ENSMUST00000216115 550 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Mir106b-201ENSMUST00000083580 82 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Srcap-206ENSMUST00000186954 9345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Parp11-201ENSMUST00000039680 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Trio-210ENSMUST00000227337 6375 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Gm40649-201ENSMUST00000219795 1457 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Gm13102-203ENSMUST00000105761 2281 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Slc38a2-201ENSMUST00000023099 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Eif2ak4-206ENSMUST00000110874 5298 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Olfr63-203ENSMUST00000217023 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Gm16487-201ENSMUST00000105048 4037 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Epb41l5-203ENSMUST00000163147 3370 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 4930471D02Rik-201ENSMUST00000180815 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Efl1-205ENSMUST00000179489 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Gm44896-201ENSMUST00000206190 772 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Bglap2-201ENSMUST00000098956 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Prpf4-201ENSMUST00000084524 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Cd163-202ENSMUST00000112541 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Myo7a-202ENSMUST00000107122 6867 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Olfr686-202ENSMUST00000214147 2646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Meis1-201ENSMUST00000068264 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Baz2a-208ENSMUST00000220049 8443 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Lamb3-202ENSMUST00000159955 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Ank3-203ENSMUST00000092431 5823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Pofut1-206ENSMUST00000123487 4143 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Commd8-201ENSMUST00000013693 3895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Usp45-202ENSMUST00000065111 6003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 St8sia4-201ENSMUST00000043336 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 AC126806.1-201ENSMUST00000217349 3869 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Pkn2-210ENSMUST00000174422 2904 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Smco3-201ENSMUST00000068293 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Rrm1-201ENSMUST00000033283 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Gm9874-202ENSMUST00000194957 1464 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Ccdc187-203ENSMUST00000227200 9528 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Col12a1-201ENSMUST00000071750 11511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Wdfy4-202ENSMUST00000130509 10158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Gm42771-201ENSMUST00000198342 2486 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Ctsc-203ENSMUST00000131108 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Luzp4-201ENSMUST00000101185 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Selenof-202ENSMUST00000106211 1178 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Gm15845-201ENSMUST00000130244 996 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Gm11963-201ENSMUST00000149826 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 AC158750.1-201ENSMUST00000226163 634 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 AC152394.1-201ENSMUST00000227360 1086 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Gm22581-201ENSMUST00000083735 136 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Glmp-209ENSMUST00000177005 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Abraxas1-203ENSMUST00000117364 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Adam22-206ENSMUST00000115386 9056 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Olfr1189-202ENSMUST00000213679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Gdap1-201ENSMUST00000026879 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 9630028H03Rik-201ENSMUST00000129868 2364 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Cyld-201ENSMUST00000043526 8022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Asph-211ENSMUST00000108339 6453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Olfr157-201ENSMUST00000214281 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Cntnap4-202ENSMUST00000118171 4860 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Arhgap19-202ENSMUST00000163265 5058 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Mmp10-201ENSMUST00000034488 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Gm29571-201ENSMUST00000191547 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Klf10-202ENSMUST00000226363 2917 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Gm33280-201ENSMUST00000193983 4340 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Grk3-201ENSMUST00000065167 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Cct8-203ENSMUST00000175977 1470 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc180J3QNE4 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms