Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 CT009550.2-201ENSMUST00000228851 399 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Olfr905-201ENSMUST00000051111 937 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 P2ry14-201ENSMUST00000065220 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Trpm8-204ENSMUST00000171176 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Btbd3-201ENSMUST00000075410 4940 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 9030607J07Rik-201ENSMUST00000202228 1622 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Atxn7l1-201ENSMUST00000077456 1624 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Slu7-206ENSMUST00000178622 3566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Vmn1r70-204ENSMUST00000228090 3185 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm10743-201ENSMUST00000219611 2358 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm12919-201ENSMUST00000119855 1594 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm44021-201ENSMUST00000203055 3516 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Ptgfr-202ENSMUST00000106126 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 4933406J09Rik-201ENSMUST00000203352 1505 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Olfr460-202ENSMUST00000216942 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 A730017C20Rik-201ENSMUST00000058633 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Ndrg3-201ENSMUST00000069600 2612 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm43113-201ENSMUST00000199713 1754 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm44117-201ENSMUST00000204442 1758 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Vmn1r37-205ENSMUST00000227923 1773 ntAPPRIS P2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Trmt10b-201ENSMUST00000044673 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Mstn-201ENSMUST00000027269 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm6350-201ENSMUST00000195099 1339 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Olfr845-202ENSMUST00000213344 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Mef2c-228ENSMUST00000199450 2862 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm22470-201ENSMUST00000104117 130 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm11865-201ENSMUST00000118093 859 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Cbx5-203ENSMUST00000122182 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm15845-201ENSMUST00000130244 996 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Ighv2-9-1-201ENSMUST00000180013 369 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm26959-201ENSMUST00000182376 978 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm28512-201ENSMUST00000187415 762 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm37225-201ENSMUST00000193423 325 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm38063-201ENSMUST00000193990 342 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm43346-201ENSMUST00000198290 685 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm2505-201ENSMUST00000200413 825 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm4605-201ENSMUST00000203148 625 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm19065-201ENSMUST00000203269 788 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm44252-201ENSMUST00000204187 330 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Reg1-203ENSMUST00000204687 904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Olfr97-202ENSMUST00000207414 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm7394-201ENSMUST00000209138 1032 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm39383-201ENSMUST00000216894 1009 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm32515-201ENSMUST00000219396 350 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm4796-201ENSMUST00000219802 624 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 AC164424.3-201ENSMUST00000220809 148 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 CT030260.1-201ENSMUST00000223243 442 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 AC166358.8-201ENSMUST00000223288 105 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 AC124739.1-201ENSMUST00000223433 148 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 AC154487.1-201ENSMUST00000224649 226 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Olfr1259-201ENSMUST00000090695 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Atp1a4-201ENSMUST00000111243 3470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Kif4-ps-201ENSMUST00000184686 3665 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Recql5-201ENSMUST00000021097 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm18957-201ENSMUST00000197623 1813 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Sorbs2-207ENSMUST00000130011 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 4930511M06Rik-203ENSMUST00000137603 2651 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Kmo-201ENSMUST00000040250 2695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Zc3h11a-201ENSMUST00000027736 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gimap6-202ENSMUST00000119315 3179 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Cd44-204ENSMUST00000111190 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 CT030170.4-203ENSMUST00000221062 1403 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Slc4a4-201ENSMUST00000113216 2518 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm44101-201ENSMUST00000203951 2221 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Trp63-205ENSMUST00000115306 4691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Ston1-201ENSMUST00000064035 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm45876-201ENSMUST00000212698 2709 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Dock9-208ENSMUST00000212376 8107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 AI182371-207ENSMUST00000226972 1642 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Kcne3-203ENSMUST00000178946 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm42514-201ENSMUST00000196636 1832 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm38302-201ENSMUST00000191676 2076 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Klrc2-205ENSMUST00000145984 2811 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Trav9-2-201ENSMUST00000103654 563 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Iglv1-201ENSMUST00000103746 391 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm25614-201ENSMUST00000104013 133 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm23527-201ENSMUST00000104570 130 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Borcs8-202ENSMUST00000110139 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm16221-201ENSMUST00000117331 393 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm11880-201ENSMUST00000117612 399 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M1F7CXU4 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms