Protein–RNA interactions for Protein: B2RRF6

Znf518a, Zinc finger protein 518A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518aB2RRF6 Gm43169-201ENSMUST00000199544 4734 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Tdrd1-201ENSMUST00000078723 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Sh2d2a-201ENSMUST00000029709 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Cysltr2-201ENSMUST00000044664 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 9030624J02Rik-201ENSMUST00000033280 2934 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Gm19410-201ENSMUST00000207505 6352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Gm28515-201ENSMUST00000189823 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Gm16153-201ENSMUST00000132184 4118 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Gm12789-202ENSMUST00000106915 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Gm13373-201ENSMUST00000144634 655 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Glipr1-204ENSMUST00000162508 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 BC024386-205ENSMUST00000210080 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Gm6436-201ENSMUST00000077163 451 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Hdac4-201ENSMUST00000008995 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 D430018E03Rik-201ENSMUST00000181842 3832 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Nrp2-205ENSMUST00000114155 6534 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Gm14565-201ENSMUST00000140021 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Olfr701-201ENSMUST00000075414 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Slco5a1-207ENSMUST00000188454 8463 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Grik1-202ENSMUST00000072256 3655 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Gm6921-201ENSMUST00000161478 435 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Gm37336-201ENSMUST00000192794 760 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Snurf-201ENSMUST00000194059 216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Gm37285-201ENSMUST00000194465 1139 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Skint10-202ENSMUST00000068851 493 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Rpl31-ps17-201ENSMUST00000097040 378 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Map4k4-215ENSMUST00000195259 3719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Gin1-201ENSMUST00000027571 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 AC105958.1-201ENSMUST00000214783 2144 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Gm28892-201ENSMUST00000188123 2721 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 4930503L19Rik-207ENSMUST00000212982 1415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Clec1a-202ENSMUST00000203162 5128 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 R3hdm2-201ENSMUST00000064793 4175 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Catsperg1-202ENSMUST00000069861 2251 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 AC115760.1-201ENSMUST00000225160 1327 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Rgr-201ENSMUST00000022338 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Vmn1r193-203ENSMUST00000227562 6840 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 AC132474.1-201ENSMUST00000214407 3686 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Gm6249-201ENSMUST00000211142 3314 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Atg7-202ENSMUST00000169310 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Gja5-201ENSMUST00000072600 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Trdmt1-202ENSMUST00000124488 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Gm5793-201ENSMUST00000119393 630 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Gm15181-201ENSMUST00000120142 177 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Gm19340-201ENSMUST00000221995 345 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 AC154558.1-201ENSMUST00000222278 415 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Tmem173-201ENSMUST00000115728 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Kcnu1-202ENSMUST00000120653 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Adamtsl1-203ENSMUST00000107178 7839 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Gm37120-201ENSMUST00000193350 5959 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Pah-201ENSMUST00000020241 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Lig3-201ENSMUST00000021039 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Cntnap4-202ENSMUST00000118171 4860 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 4932415M13Rik-202ENSMUST00000184645 3063 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Otud7b-203ENSMUST00000098849 8046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Nolc1-203ENSMUST00000223728 3523 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Tcf4-206ENSMUST00000114982 3694 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Zfp451-202ENSMUST00000044455 11876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Gm15618-201ENSMUST00000121610 452 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Gm25782-201ENSMUST00000122526 289 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf518aB2RRF6 Gm27998-201ENSMUST00000184902 361 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms