Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprsB0V2N1 Gm28515-201ENSMUST00000189823 2530 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PtprsB0V2N1 4930412C18Rik-202ENSMUST00000138390 3839 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
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PtprsB0V2N1 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PtprsB0V2N1 Efcab6-207ENSMUST00000156187 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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PtprsB0V2N1 Gm15080-201ENSMUST00000112804 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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PtprsB0V2N1 Gm12590-201ENSMUST00000134226 404 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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PtprsB0V2N1 Map3k19-205ENSMUST00000208183 4865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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PtprsB0V2N1 Mettl16-205ENSMUST00000141755 12584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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PtprsB0V2N1 Ctage5-223ENSMUST00000219140 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtprsB0V2N1 Tsc1-203ENSMUST00000113869 7702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtprsB0V2N1 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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PtprsB0V2N1 Gm13444-201ENSMUST00000119445 522 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
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