Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 U2af1l4-205ENSMUST00000163482 668 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Vmn2r-ps77-201ENSMUST00000174505 320 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Obox4-ps38-201ENSMUST00000175961 724 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 2610528A11Rik-201ENSMUST00000179488 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Hdac5Q9Z2V6 Gm27597-201ENSMUST00000184365 80 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gm27506-201ENSMUST00000184558 80 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gm27529-201ENSMUST00000184975 80 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gm27907-201ENSMUST00000185101 80 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
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Hdac5Q9Z2V6 Gm36965-201ENSMUST00000193797 394 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gm37381-202ENSMUST00000194643 657 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Hdac5Q9Z2V6 Gm45608-201ENSMUST00000210948 389 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
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Hdac5Q9Z2V6 4930415O20Rik-201ENSMUST00000023728 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Slc36a3-202ENSMUST00000069816 893 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Cytl1-201ENSMUST00000073554 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Hdac5Q9Z2V6 Wrn-204ENSMUST00000211498 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Ces3a-202ENSMUST00000093223 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Dhrs7b-202ENSMUST00000108718 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Fmn1-203ENSMUST00000102547 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Bbs9-211ENSMUST00000150395 3425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Fbxo9-201ENSMUST00000001402 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Mtbp-205ENSMUST00000170046 3197 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r5-203ENSMUST00000228276 3188 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Tep1-201ENSMUST00000006444 8171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gm9936-201ENSMUST00000201635 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gm45237-202ENSMUST00000211157 2452 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Zfp931-201ENSMUST00000108923 1372 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Grip1-213ENSMUST00000147454 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Foxp3-202ENSMUST00000115738 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Skint7-201ENSMUST00000055014 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Tex24-201ENSMUST00000095375 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Dusp27-202ENSMUST00000192369 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Plxna4-201ENSMUST00000115096 12877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Wdfy4-202ENSMUST00000130509 10158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1350-202ENSMUST00000207221 1521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Hdac5Q9Z2V6 Gm42455-201ENSMUST00000199761 2736 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Nolc1-203ENSMUST00000223728 3523 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Htr4-201ENSMUST00000027560 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Commd8-201ENSMUST00000013693 3895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 B4galnt3-201ENSMUST00000057283 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gm37902-201ENSMUST00000192839 1683 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Trappc1-202ENSMUST00000102601 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Zfp971-201ENSMUST00000108925 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Hdac5Q9Z2V6 Rab5a-ps-201ENSMUST00000203252 653 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
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Hdac5Q9Z2V6 Gm44135-201ENSMUST00000205221 368 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gm7419-201ENSMUST00000209962 925 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 AC121844.1-201ENSMUST00000218706 137 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 AC192333.4-201ENSMUST00000224269 981 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Agr3-201ENSMUST00000042101 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Capsl-201ENSMUST00000042360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Mrgprb4-201ENSMUST00000094388 1219 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Alg8-201ENSMUST00000098300 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gm8728-201ENSMUST00000207367 2178 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gm8486-201ENSMUST00000207508 2171 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gm8685-201ENSMUST00000207567 2183 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gm16443-201ENSMUST00000207909 2184 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Phc3-202ENSMUST00000064718 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gm28653-201ENSMUST00000185494 5276 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Col12a1-201ENSMUST00000071750 11511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Sorbs1-211ENSMUST00000224667 4313 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Gm12187-201ENSMUST00000119584 1375 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Casp8-202ENSMUST00000165549 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Zfp82-207ENSMUST00000183190 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Bbs9-201ENSMUST00000039798 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hdac5Q9Z2V6 Tmem174-201ENSMUST00000050389 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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