Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm43709-201ENSMUST00000199870 559 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm43004-201ENSMUST00000201872 703 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Crcp-206ENSMUST00000202756 600 ntTSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm7482-201ENSMUST00000206446 505 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm7839-201ENSMUST00000210755 673 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 AC126673.2-201ENSMUST00000221052 686 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm31063-201ENSMUST00000222636 580 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 AC102815.1-201ENSMUST00000226662 1061 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 AC167013.3-201ENSMUST00000228110 989 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
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Rabgef1Q9JM13 Olfr214-201ENSMUST00000060204 1008 ntAPPRIS P1 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm21541-201ENSMUST00000098128 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Rasef-202ENSMUST00000102837 5158 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
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Rabgef1Q9JM13 Zfp758-204ENSMUST00000149699 2876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
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Rabgef1Q9JM13 Tcf20-201ENSMUST00000048966 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 2310015D24Rik-202ENSMUST00000187920 2917 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Calcr-205ENSMUST00000171613 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
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Rabgef1Q9JM13 Clec1a-202ENSMUST00000203162 5128 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
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Rabgef1Q9JM13 Zfp438-201ENSMUST00000063989 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
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Rabgef1Q9JM13 D330045A20Rik-201ENSMUST00000046763 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
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Rabgef1Q9JM13 Tnik-203ENSMUST00000159680 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm28515-201ENSMUST00000189823 2530 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
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Rabgef1Q9JM13 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
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Rabgef1Q9JM13 Gm10451-202ENSMUST00000219367 855 ntTSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 AC155269.1-201ENSMUST00000220843 769 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
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Rabgef1Q9JM13 Olfr479-201ENSMUST00000063151 1111 ntAPPRIS P1 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Fabp3-ps1-201ENSMUST00000070435 402 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Olfr921-201ENSMUST00000071681 1181 ntAPPRIS P1 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm9761-201ENSMUST00000075650 492 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Olfr310-201ENSMUST00000081918 1082 ntAPPRIS P1 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm5458-201ENSMUST00000096121 997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Adcy10-202ENSMUST00000111439 5193 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Ntsr1-201ENSMUST00000029084 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Rufy3-201ENSMUST00000031229 4049 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Ncald-204ENSMUST00000120746 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Usp54-202ENSMUST00000035340 6495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm14373-201ENSMUST00000122467 2158 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
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