Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Slc25a53-202ENSMUST00000113069 3189 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 4933424H11Rik-201ENSMUST00000200511 2018 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Phactr2-204ENSMUST00000105546 2808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 4933406L23Rik-201ENSMUST00000203567 1509 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Ceacam1-208ENSMUST00000206676 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm14248-201ENSMUST00000117790 544 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm24130-201ENSMUST00000158536 151 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Slc25a5-ps-201ENSMUST00000162199 826 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm17149-201ENSMUST00000164712 375 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm27373-201ENSMUST00000184017 184 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Oosp1-203ENSMUST00000186557 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm5575-201ENSMUST00000190879 398 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm44712-201ENSMUST00000206250 1076 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 4933431C10Rik-201ENSMUST00000208973 1266 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 AC154487.1-201ENSMUST00000224649 226 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 1700123O20Rik-203ENSMUST00000227269 893 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Myl12a-201ENSMUST00000024846 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm8844-201ENSMUST00000119460 2614 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm37460-201ENSMUST00000191796 2249 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 F930017D23Rik-202ENSMUST00000213342 2141 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Pmfbp1-201ENSMUST00000034162 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Pcsk2os1-201ENSMUST00000126735 4233 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm43398-201ENSMUST00000196584 2742 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Cd84-203ENSMUST00000135386 3434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm6567-201ENSMUST00000205529 2095 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Ccdc150-201ENSMUST00000027128 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm45470-201ENSMUST00000209685 7044 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 B230303O12Rik-201ENSMUST00000199119 3645 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Ighv9-1-201ENSMUST00000103471 294 ntAPPRIS P1 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm25614-201ENSMUST00000104013 133 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm14156-201ENSMUST00000121538 483 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm12410-201ENSMUST00000124989 405 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 A330102I10Rik-203ENSMUST00000145801 737 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm15787-207ENSMUST00000152014 885 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gpx2-ps1-201ENSMUST00000160622 571 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 1700028D13Rik-202ENSMUST00000187272 675 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm34225-203ENSMUST00000206921 572 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm20274-201ENSMUST00000206967 584 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm45309-201ENSMUST00000211528 695 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 AC165154.2-201ENSMUST00000227310 336 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Rhox4b-201ENSMUST00000096458 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm340-201ENSMUST00000172371 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm28819-202ENSMUST00000187416 1335 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Rftn2-201ENSMUST00000027121 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Zfa-ps-201ENSMUST00000180526 2231 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm44898-201ENSMUST00000205934 2223 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 9230106D20Rik-201ENSMUST00000052806 1406 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Dnah5-201ENSMUST00000067048 15637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm15054-201ENSMUST00000117393 281 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm8644-201ENSMUST00000118619 596 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Hnf1aos1-203ENSMUST00000131845 740 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm14664-201ENSMUST00000142919 437 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Ighv13-2-202ENSMUST00000183954 302 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm29230-201ENSMUST00000189687 412 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm6197-201ENSMUST00000192273 454 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm42650-201ENSMUST00000197038 575 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm29977-201ENSMUST00000206804 724 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm7394-201ENSMUST00000209138 1032 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Ctxn3-203ENSMUST00000209786 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm45888-201ENSMUST00000212348 1229 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm6581-201ENSMUST00000214545 260 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 AC118476.2-201ENSMUST00000215206 757 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Parp8-203ENSMUST00000223949 2965 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Cst11-201ENSMUST00000028934 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Rfwd3-201ENSMUST00000038739 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
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