Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 4930503L19Rik-207ENSMUST00000212982 1415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Mroh2b-201ENSMUST00000045736 4829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm22438-201ENSMUST00000104049 132 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm15763-201ENSMUST00000120136 403 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm12175-201ENSMUST00000122081 345 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm13485-201ENSMUST00000146690 659 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm10364-202ENSMUST00000153034 1001 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r29-201ENSMUST00000168416 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm8245-201ENSMUST00000182434 987 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm44788-201ENSMUST00000207605 385 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm45391-201ENSMUST00000211563 576 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 AC153847.1-201ENSMUST00000214524 353 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 CT030709.2-201ENSMUST00000215521 399 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 CT009713.5-201ENSMUST00000224508 909 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Olfr290-201ENSMUST00000073468 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Sorbs1-202ENSMUST00000099467 2817 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm4961-201ENSMUST00000197982 2249 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Cdon-201ENSMUST00000042842 7213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Arhgef9-209ENSMUST00000181987 6222 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Hipk2-205ENSMUST00000160962 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Snapc4-201ENSMUST00000035427 4363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Edar-201ENSMUST00000003312 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 2610203C22Rik-204ENSMUST00000148585 3475 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Pkd1l1-203ENSMUST00000178195 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Tmem245-201ENSMUST00000068792 15981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Itgae-202ENSMUST00000102537 3825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Csde1-211ENSMUST00000198180 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1360-202ENSMUST00000205788 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm6509-202ENSMUST00000201552 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Galntl6-207ENSMUST00000204067 1592 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm37534-201ENSMUST00000194483 5222 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm28892-201ENSMUST00000188123 2721 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm6710-201ENSMUST00000109011 1445 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Rgs8-203ENSMUST00000111812 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Abraxas1-203ENSMUST00000117364 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm29660-201ENSMUST00000185631 2166 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm29309-201ENSMUST00000186251 2166 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm28317-201ENSMUST00000187200 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm28254-201ENSMUST00000189207 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm29063-201ENSMUST00000190236 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm29632-201ENSMUST00000190335 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm28538-201ENSMUST00000190919 2166 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1232-202ENSMUST00000213860 2413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Patl2-201ENSMUST00000028665 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm14847-201ENSMUST00000121978 519 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Erich2os-201ENSMUST00000150702 608 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Ccdc71Q8VEG0 Gm29363-201ENSMUST00000189365 621 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm38256-201ENSMUST00000192097 950 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 AC099760.1-201ENSMUST00000196300 153 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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Ccdc71Q8VEG0 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Tespa1-202ENSMUST00000217702 1102 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 AC153152.2-201ENSMUST00000223165 959 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 AC164294.1-201ENSMUST00000224682 688 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm6563-201ENSMUST00000056396 869 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Fam47e-201ENSMUST00000082382 750 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1012-201ENSMUST00000099916 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm37739-201ENSMUST00000191742 1505 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm38003-201ENSMUST00000191968 1504 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Fbxw20-201ENSMUST00000079548 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm17167-201ENSMUST00000169242 5054 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 C5ar2-201ENSMUST00000098792 3429 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 C79798-201ENSMUST00000131588 1793 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Psg18-202ENSMUST00000098783 1783 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Ppargc1a-205ENSMUST00000196968 2754 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Ttc9c-202ENSMUST00000096751 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Myh10-202ENSMUST00000092984 7759 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Lyve1-201ENSMUST00000033050 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Ifit1bl2-202ENSMUST00000112463 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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